Brothers har föreslagit att amygdala är en viktig komponent i det neurala nätverk som ligger till grund för social kognition. Och Bauman och Kemper observerade tecken på neuropatologi i amygdala i den post mortem autistiska hjärnan. Dessa fynd, tillsammans med nya uppgifter om funktionell neuroimaging, har fått Baron-Cohen och kollegor att föreslå att en dysfunktion i amygdala delvis kan vara ansvarig för den försämring av den sociala funktionsförmågan som är ett utmärkande kännetecken för autism. Nya uppgifter från studier i vårt laboratorium om effekterna av skador på amygdala hos makakapor går emot en grundläggande roll för amygdala i socialt beteende. Om amygdala inte är nödvändig för normalt socialt beteende, vilket verkar vara fallet både hos icke-mänskliga primater och hos utvalda patienter med bilaterala amygdala-skador, är det osannolikt att den är substratet för det onormala sociala beteendet vid autism. En skada på amygdala har dock en effekt på apornas reaktion på normalt rädslaframkallande stimuli, t.ex. ormar, och tar bort en naturlig motvilja mot att engagera nya artfränder i sociala interaktioner. Dessa resultat leder till slutsatsen att amygdala har en viktig roll när det gäller att upptäcka hot och mobilisera en lämplig beteendemässig reaktion, där rädsla är en del av den. Om amygdala är patologisk hos personer med autism kan det bidra till deras onormala rädsla och ökade ångest snarare än till deras onormala sociala beteende.