CAZy

Denna artikel handlar om databasen. För samhället i USA, se Cazy, West Virginia.

CAZy är en databas över kolhydrataktiva enZymes (CAZymes). Databasen innehåller en klassificering och tillhörande information om enzymer som är involverade i syntes, metabolism och igenkänning av komplexa kolhydrater, dvs. disackarider, oligosackarider, polysackarider och glykokonjugater. Databasen omfattar familjer av glykosidhydrolaser, glykosyltransferaser, polysackaridlyaser, kolhydratesteraser och icke-katalytiska kolhydratbindande moduler. CAZy-databasen innehåller också en klassificering av redoxenzymer med hjälpaktivitet som deltar i nedbrytningen av lignocellulosa.

CAZy

Database.png

Innehåll

Beskrivning

Databas över kolhydrataktiva enzymer

Kontakt

Forskningscentrum

AFMB, Franska nationella centret för vetenskaplig forskning

Laboratorium

Glykogenomikgruppen

Primärt citat

Lombard & al. (2014)

Access

Website

http://www.cazy.org/

Tools

Web

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZy inrättades 1999 för att ge online-tillgång till och ständigt uppdaterad tillgång till den sekvensbaserade proteinsekvensbaserade familjeklassificeringen av CAZymes, som ursprungligen utvecklades i början av 1990-talet för att klassificera glykosidhydrolaser. Nya poster läggs till kort efter att de dyker upp i de dagliga versionerna av GenBank. Den snabba utvecklingen av DNA-sekvensering med hög kapacitet har resulterat i en fortsatt exponentiell tillväxt av CAZy-databasen, som nu omfattar hundratusentals sekvenser. CAZy fortsätter att kureras och utvecklas av gruppen för glykogenomik vid AFMB, ett forskningscentrum som är knutet till det franska nationella centret för vetenskaplig forskning och Aix-Marseille-universitetet.

CaZy-databasen är kopplad till CAZypedia, som lanserades 2007 som ett forskarsamhällsdrivet, wikibaserat uppslagsverk över CAZymes.

Lämna en kommentar