Sjukhuset har sitt ursprung i ett barnhem enligt fattiglagen som inrättades 1886. Den äldsta delen av sjukhuset, byggnaden ”klocktornet”, var tidigare huvuddelen av barnhemmet. Middlesex County Council började ta emot äldre personer till anläggningen 1930 och den hade utvecklats till ett vårdhem för äldre personer 1938. Anläggningen anslöt sig till National Health Service 1948 och ett nytt kirurgiskt block, känt som Highlands Wing till minne av det lokala Highlands Hospital som nyligen hade stängt, öppnades 1995. År 1999 blev sjukhuset en del av Barnet and Chase Farm NHS Hospitals Trust.
Under 2007 genomfördes ett offentligt samråd om att omorganisera tjänsterna mellan Chase Farm Hospital och Barnet Hospital. Ett alternativ skulle ha omvandlat Chase Farm till ett ”community hospital” där slutenvård och större akutvård skulle ha överförts till Barnet. Enligt det andra alternativet skulle planerad vård koncentreras till Chase Farm, medan förlossningsvård och andra tjänster skulle koncentreras till Barnet. Förslagen syftade till att maximera den kliniska effektiviteten med tanke på de begränsade mänskliga och ekonomiska resurserna, men de förutsatte också en betydande investering i samhällssjukvård (vilket aldrig blev verklighet). De lokala NHS-primärvårdsförvaltningarna beslutade i slutet av detta samråd (där endast 2 % av lokalbefolkningen svarade) att fortsätta med ”alternativ 2”. Två kandidater, Catherine Wilkinson och Kieran McGregor, för rörelsen ”Save Chase Farm” valdes in i kommunfullmäktige i lokalvalet i maj 2006. De förlorade dock sina platser i valet 2010. Efter avslag på en begäran om rättslig prövning stängdes förlossningsavdelningen i november 2013 och akutmottagningen den 9 december 2013 efter fastställandet av strategin för Barnet, Enfield och Haringey.
Sedan 2014 är sjukhuset en del av Royal Free London NHS Foundation Trust. Trustet upptäckte en stor eftersläpning av patienter som väntade på elektiv behandling det året. I april 2015 hade trusten granskat 7 174 patienter som nu har fått behandling. I granskningen drogs slutsatsen att en patient ”kan ha lidit allvarlig skada”, 39 patienter hade ”potentiellt” lidit ”måttlig skada” och 68 patienter kan ha lidit ”liten skada”. 1 541 patienter skickades till privata leverantörer sedan juli 2014, främst för endoskopi och öron-, näs- och halsbehandlingar.
En ombyggnadsplan för anläggningen, som delvis finansieras av regeringen och delvis från intäkterna från överskottsmark, innebär att de flesta av de befintliga byggnaderna ska rivas, med undantag för Highlands Wing och en del av klocktornsbyggnaden, och att moderna anläggningar ska byggas upp. Arbetena beräknas vara klara sommaren 2018.