De grundläggande värderingar som Cooperative Baptist Fellowship upprätthåller börjar med fyra punkter som CBF anser vara baptistiska principer för tro och praktik.
- Själslig frihet är alla människors förmåga att relatera direkt till Gud. Tron på alla troendes prästadöme är en viktig grund för denna princip.
- Bibelfrihet är principen om att erkänna Skriftens auktoritet och varje kristens rätt att tolka den så som den Helige Ande leder den.
- Kyrkofrihet är idén om att varje lokalkyrka är självständig och har befogenhet att välja sina egna ledare och leda sina egna angelägenheter.
- Religionsfrihet är principen om åtskillnad mellan kyrka och stat. CBF stöder denna princip genom anslutning till Baptist Joint Committee for Religious Liberty.
CBF bekräftar att Bibeln lär att det finns en sann Gud som har skapat alla människor. På grund av synden är mänskligheten avskild från Gud men kan räddas och återlösas genom Jesus Kristus. Den helige Ande överbevisar och omvänder dem som tror på Kristus och ger kyrkan kraft att fullgöra sitt uppdrag. CBF:s medlemmar är överens om att varje kristen och varje kyrka är kallad att uppfylla missionsbefallningen, dela evangeliet om Jesus Kristus och tjäna de andliga, fysiska och sociala behoven hos människor och samhällen.
Affirmation av kvinnor i tjänst var en av de grundläggande principerna för Fellowship. De flesta CBF-medlemmar är överens om att både män och kvinnor kan ordineras till präster eller diakoner och tjänstgöra som pastorer i kyrkor. I sociala frågor gör CBF inga ställningstaganden. CBF:s medlemmar är överens om att eftersom CBF är en gemenskap av självständiga kyrkor skulle det ligga utanför dess syfte att utfärda uttalanden. Den har dock en organisationspolicy om homosexuellt beteende. CBF:s policy är dock inte bindande för enskilda församlingar som fattar sina egna beslut i alla frågor; inte heller kan en församling uteslutas ur CBF för att den inte håller med om grundläggande värderingar eller policy. Calvary Baptist Church i Lexington, KY, en ledande medlemsförsamling i CBF, tillåter till exempel homosexuella att tjänstgöra i ledningen, bland annat som diakon, och Calvary Baptist Church i DC, en annan medlemsförsamling, genomför samkönade äktenskap. Dessutom sponsrade CBF tillsammans med andra en konferens om sexualitet och tog initiativ till ”’Illumination Project’ som godkänts av styrelsen (tidigare samordningsrådet) för att utveckla modeller för hur samfundet i gemenskapen kan vädra meningsskiljaktigheter, inte bara när det gäller anställningsförbudet, utan även andra heta frågor som splittrar kyrkor, samfund och samhälle”.