En översikt över hur hjärnan kan beräkna föreslås. I hjärnbarken lagras minnen genom långtidspotentiering vid synapser från kortikala ingångar i lager 1 (som representerar sammanhang) på pyramidala celler i lager 2/3 som är kopplade till thalamus i en kortiko-thalamisk (CT) enhet. De signaler som memoreras är inmatningar i lager 3 från thalamus eller andra kortikala områden. Signalerna memoreras (och återkallas senare) vid gammafrekvensen. En medveten tanke består av utgångarna från celler i skikt 5 i CT-enheter i olika kortikala områden som avfyras synkront genom bidrag från oscillatoriska thalamiska och kortikala inflöden. Detta kortikala resultat påverkar subkortikala områden för att orsaka eller delta i en rörelse. De cerebrala kortikala resultaten kan lagras i lillhjärnan och genereras senare i ett visst sammanhang av basalganglierna och lillhjärnan. Hjärnan kan alltså antingen generera ”medvetna” utgångar med hjälp av hjärnbarken eller ”automatiska” utgångar med hjälp av basala ganglier och lillhjärnan. När basalganglierna känner igen sammanhanget kan de utgångar som lagrats i lillhjärnan påbörjas, och på detta sätt kan basalganglierna styra komplexa sekvenser av utgångar eller rörelser. Arbetsminnet involverar den prefrontala cortex med hjälp av basala ganglier och lillhjärnan. Hippocampus har en roll i lagringen och återkallandet av kortikala resultat genom att tillhandahålla unika lager 1-sammanhang till alla CT-slingor i olika kortikala områden i en medveten tanke. Vid ytterligare återkallande av tanken kan nya lager 1-kontexter associeras med CT-slingorna, vilket gör det möjligt att återkalla dem utan hippocampus input.