Kapnofiler är mikroorganismer som trivs i närvaro av höga koncentrationer av koldioxid (CO
2).
Vissa kapnofiler kan ha ett metaboliskt behov av koldioxid, medan andra bara konkurrerar mer framgångsrikt om resurser under dessa förhållanden. Termen är allmänt beskrivande och har mindre relevans som ett sätt att fastställa ett taxonomiskt eller evolutionärt förhållande mellan organismer med denna egenskap.
Till exempel kan kapnofilers förmåga att tolerera (eller utnyttja) den mängd syre som också finns i deras omgivning variera kraftigt och kan vara betydligt mer kritisk för deras överlevnad. Arter av Campylobacter är bakteriella capnofiler som är lättare att identifiera eftersom de också är mikroaerofiler, organismer som kan växa i hög koldioxidhalt så länge som en liten mängd fritt syre finns närvarande, men i en dramatiskt minskad koncentration. (I jordens atmosfär är koldioxidhalten ungefär femhundra gånger lägre än syrehalten, 0,04 % respektive 21 % av den totala halten). Obligata anaerober är mikrober som dör i närvaro av syre utan hänsyn till koldioxidhalten i sin omgivning, och de skaffar sig vanligen energi genom anaerob andning eller fermentering.
År 2004 karakteriserades en kapnofil bakterie som tycks kräva koldioxid. Denna organism, Mannheimia succiniciproducens, har en unik metabolism som innefattar kolfixering. Medan kolfixering är vanligt förekommande hos de flesta växtlivet på jorden eftersom det är det viktigaste inledande steget i biosyntesen av komplexa kolföreningar under fotosyntesen (Calvin-cykeln), finns den hos relativt få mikroorganismer och inte hos djur. M. succiniciproducens kan koppla koldioxid till den trekoliga ryggraden av fosfenolpyruvat, en slutprodukt i glykolysen, för att generera den fyrkoliga föreningen oxaloättiksyra, en mellanprodukt i Krebscykeln. Även om M. succiniciproducens har de flesta intermediärerna i Krebscykeln verkar den oförmögen till aerob respiration och använder i stället fumarat som slutlig elektronacceptor.