OMIM Entry – * 410000 – AMELOGENIN, Y-CHROMOSOMAL; AMELY

TEXT

Under studiet av DNA-fragmentkloner från människans Y-kromosom hittade Nakahori et al. (1991) en klon, AMELY, som var särskilt välbevarad i däggdjurens evolution. Homologa sekvenser hittades på X-kromosomen (AMELX; 300391). Sekvenserna var homologa med tidigare sekvenserade cDNA-kloner från mus och nötkreatur som kodar för amelogenin.

Salido et al. (1992) presenterade bevis från studier av tandknoppar som utvecklas hos hanar att både AMGX-genen och AMGY-genen är transkriptionellt aktiva. Promotorregionen och de predikterade proteinsekvenserna för båda generna presenterades. Dessa är inte pseudoautosomala gener eftersom honor som är heterozygota för mutationer i AMGX-genen som orsakar amelogenesis imperfecta uppvisar lyonisering, dvs. ett mosaikmönster av emaljavvikelser.

Nakahori et al. (1991) identifierade 3 exoner i både AMELY- och AMELX-generna.

AMELY-genen på Y-kromosomen motsvarar AMELX-genen som kartlades till kromosom Xp22.3-p22.1 av Lau et al. (1989). Lau et al. (1989) tilldelade AMELY-genen till den pericentriska regionen av Y-kromosomen, möjligen Yq11, genom hybridisering med DNA från hybridceller mellan människa och mus som innehåller olika deletioner av X- och Y-kromosomerna. Det eventuella sambandet med det Y-kromosomala locus som postulerats för tandstorlek, som kartläggs i ungefär samma område (se 475000), är oklart.

Amelogeningenen hos musen verkar vara lokaliserad enbart på X-kromosomen (Chapman et al., 1991).

Med hjälp av deletionskartläggning, baserad på analys av DNA från en serie XX-patienter av manligt kön (med X-Y-växling) och individer med avvikande Y-kromosomer, fick Bailey et al. (1992) resultat som avviker från de rapporter som kartlägger AMELY till proximala Yq. Deras resultat av en placering på Yp skulle kunna förenas genom att postulera förekomsten av pericentriska inversionspolymorfismer på Y i den allmänna befolkningen. Denna hypotes skulle kunna testas genom att använda in situ-hybridisering för att undersöka Y-lokaliseringen av AMELY på en stor serie normala Y-kromosomer.

Faerman et al. (1995) utvecklade en känslig och tillförlitlig metod baserad på amplifiering av AMG-genen för identifiering av kön i arkeologiska mänskliga kvarlevor. AMGY-allelen bär på en liten deletion i det första intronet, vilket underlättar utformningen av distinkta X- och Y-specifika PCR-primer. Med hjälp av metoden bestämdes könet från skelettrester av 18 individer, inklusive små barn, av 22 undersökta från perioder som sträcker sig från 200 till cirka 8 000 år sedan. Kortikala och kraniala ben samt tänder visade sig ge tillräckligt bevarat DNA.

Lattanzi et al. (2005) hittade en stor interstitiell deletion av den korta Y-armen som omfattar AMELY-lokuset hos två obesläktade individer. Det ena fallet identifierades från ett urval av 493 infertila män; det andra uppkom från studier som gjorts på 13 000 oselekterade fostervattenprover från graviditeter med manliga foster (vilket indikerar en total prevalens på 0,008 %). Lattanzi et al. (2005) kommenterade att även om frekvensen av amelogenin-deletionen är låg bör man inte dra slutsatser om kön baserat enbart på amelogenin i situationer som rör prenatal diagnostik, faderskapstester eller brottsutredningar.

Med hjälp av en kombination av kartläggning av STS-deletioner, haplotypning av binära markörer och Y-kort tandemrepetitioner samt uppskattning av antalet kopior av TSPY (480100) identifierade Jobling et al. (2007) 4 olika klasser av deletioner som påverkar kromosom Yp hos 45 män från 12 olika populationer. Den vanligaste deletionsklassen hittades i 41 Y-kromosomer (91 %) och verkade orsakas av icke-allelisk homolog rekombination mellan den stora TSPY-repeteringen och en enda telomerisk kopia av TSPY-genen som ligger mer än 3 Mb från matrisen. Denna deletion resulterade i förlust av generna AMELY, TBL1Y (400033) och PRKY (400008), som ligger i den region som separerar den enda TSPY-genen och den upprepade TSPY-matrisen, samt minskat antal kopior av TSPY. De mer sällsynta deletionsklasserna berörde inte den stora TSPY-upprepningsraden, men resulterade i förlust av den mer telomeriska PCDH11Y-genen (400022) utöver AMELY, TBL1Y, PRKY och den enda telomeriska TSPY-kopian. Den bestående och expanderande utvecklingen av deletionslinjer, tillsammans med fenotypiska bevis, tyder på att frånvaron av dessa gener inte har några större skadliga effekter.

Med hjälp av PCR-analys fann Bailey et al. (1992) en anmärkningsvärd grad av bevarande av AMELY-primers och PCR-produktstorlek bland människoapor och apor från den gamla världen.