Alzheimers sjukdom (AD) är den vanligaste neurodegenerativa sjukdomen i världen, men dess etiologi är fortfarande inte helt klarlagd. Identifieringen av underliggande patologiska mekanismer blir allt viktigare för upptäckten av biomarkörer och terapier, för vilka metabolomik utgör en stor potential. I detta arbete studerade vi metaboliska förändringar i olika hjärnregioner hos APP/PS1-möss med hjälp av en metabolomisk metod med hög kapacitet som bygger på en kombination av gaskromatografi-masspektrometri och ultrahögpresterande vätskekromatografi-masspektrometri. Multivariat statistik visade att de metabolomiska störningarna är utbredda och främst påverkar hippocampus och cortex, men att de också förekommer i regioner som inte primärt är förknippade med Alzheimers sjukdom, t.ex. striatum, lillhjärnan och luktbulberna. Flera metaboliska vägar kan kopplas till utvecklingen av sjukdomar av AD-typ i denna musmodell, bland annat onormal purinmetabolism, bioenergetiska misslyckanden, dyshomeostas av aminosyror och störningar i membranlipider. Intressant nog observerades regionspecifika förändringar för några av de identifierade potentiella markörerna, i samband med onormal fettsyrasammansättning i fosfolipider och sfingomyeliner, eller differentiell reglering av aminosyror i neurotransmittorer (t.ex. glutamat, glycin, serin, N-acetyl-aspartat), vilket inte tidigare har beskrivits enligt vad vi vet. Därför kan dessa fynd ge en ny inblick i hjärnans patologi vid Alzheimers sjukdom.