CAZy

Questo articolo riguarda il database. Per la comunità negli Stati Uniti, vedi Cazy, West Virginia.

CAZy è un database di Carbohydrate-Active enZYmes (CAZymes). Il database contiene una classificazione e informazioni associate sugli enzimi coinvolti nella sintesi, nel metabolismo e nel riconoscimento dei carboidrati complessi, cioè disaccaridi, oligosaccaridi, polisaccaridi e glicoconiugati. Sono incluse nel database le famiglie delle idrolasi dei glicosidi, delle glicosiltransferasi, delle liasi dei polisaccaridi, delle esterasi dei carboidrati e dei moduli non catalitici di legame dei carboidrati. Il database CAZy include anche una classificazione degli enzimi redox ad attività ausiliaria coinvolti nella scomposizione della lignocellulosa.

CAZy

Database.png

Contenuto

Descrizione

Base dati degli enzimi carboidrati-attivi

Contatto

Centro di ricerca

AFMB, Centro nazionale francese per la ricerca scientifica

Laboratorio

Gruppo di glicogenomica

Citazione primaria

Lombard & al. (2014)

Accesso

Sito web

http://www.cazy.org/

Tools

Web

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZy è stato istituito nel 1999 per fornire un accesso online e costantemente aggiornato alla classificazione delle famiglie di CAZimi basata sulla sequenza delle proteine, che è stata originariamente sviluppata nei primi anni ’90 per classificare le idrolasi glicosidiche. Le nuove voci vengono aggiunte poco dopo la loro comparsa nelle versioni giornaliere di GenBank. La rapida evoluzione del sequenziamento del DNA ad alta velocità ha portato alla continua crescita esponenziale del database CAZy, che ora copre centinaia di migliaia di sequenze. CAZy continua ad essere curato e sviluppato dal gruppo Glycogenomics dell’AFMB, un centro di ricerca affiliato al Centro Nazionale Francese per la Ricerca Scientifica e all’Università di Aix-Marseille.

Il database CAZy è abbinato a CAZypedia, che è stato lanciato nel 2007 come un’enciclopedia di CAZymes guidata dalla comunità di ricerca e basata su wiki.

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