Il centimorgan (abbreviato cM, dal nome di Thomas Hunt Morgan) è un’unità di misura ausiliaria in genetica che indica la frequenza o la probabilità di ricombinazione in percentuale. In questo modo, la distanza genetica può essere quantificata, cioè la distanza genetica tra due loci su un cromosoma.
I geni situati sullo stesso cromosoma possono essere “disaccoppiati” tramite crossing over. Il numero atteso di questi eventi di cross-over può essere stimato dalla frequenza di ricombinazione (osservata).
Due loci sono distanti 1 cM se la ricombinazione (cioè La probabilità di crossing over tra questi loci è dell’1% per meiosi, cioè in media si verifica un cross over in 100 meiosi:
R e c o m b i n a z i o n e = 100 ⋅ La r e c o m b i n a z i o n e {displaystyle \mathrm {recombination\,} =100\cdot {frac {mathrm {number;of;recombinant\;gametes};totale}} 
(per la formazione di uno zigote, sono necessari due gameti, nella formazione di ognuno dei quali può essere avvenuta la ricombinazione).