| Citrato (Si)-sintasi | ||||||
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| Identificatori | ||||||
| Numero CE | 2.3.3.1 | |||||
| Numero CAS. | 9027-96-7 | |||||
| Basi di dati | ||||||
| IntEnz | VistaIntEnz | |||||
| BRENDA | BRENDA voce | |||||
| ExPASy | NiceZyme vista | |||||
| KEGG | voce KEGG | |||||
| MetaCyc | via metabolica | |||||
| PRIAM | profilo | |||||
| strutture PDB | RCSB PDBe PDBsum | |||||
| Ontologia genetica | AmiGO / QuickGO | |||||
| Search | PMC | PubMed | NCBI | |||
MechanismEdit
La citrato sintasi ha tre aminoacidi chiave nel suo sito attivo (noto come triade catalitica) che catalizzano la conversione di acetil-CoA e ossalacetato in citrato e H-SCoA in una reazione di condensazione aldolica. Questa conversione inizia con l’atomo di ossigeno della catena laterale del carbossilato caricato negativamente di Asp-375 che deprotonano l’atomo di carbonio alfa dell’acetil CoA per formare un anione enolato che a sua volta viene neutralizzato dalla protonazione di His-274 per formare un intermedio enolo. A questo punto, la coppia di elettroni solitari dell’azoto epsilon su His-274, formata nell’ultimo passaggio, estrae il protone dell’idrossile dell’enolo per riformare un anione enolato che avvia un attacco nucleofilo sul carbonio carbonile dell’ossalacetato che a sua volta deprotonare l’atomo di azoto epsilon di His-320. Questa aggiunta nucleofila porta alla formazione di citroil-CoA. A questo punto, una molecola d’acqua viene deprotonata dall’atomo di azoto epsilon dell’His-320 e l’idrolisi ha inizio. Una delle coppie solitarie dell’ossigeno attacca nucleofilicamente il carbonio carbonilico del citroil-CoA. Questo forma un intermedio tetraedrico e provoca l’espulsione di -SCoA mentre il carbonile si riforma. Il -SCoA viene protonato per formare HSCoA. Infine, l’idrossile aggiunto al carbonile nel passaggio precedente viene deprotonato e si forma il citrato.
InibizioneModifica
L’enzima è inibito da alti rapporti di ATP:ADP e NADH:NAD, poiché alte concentrazioni di ATP e NADH mostrano che la fornitura di energia è alta per la cellula. È anche inibita da succinil-CoA e propionil-CoA, che assomiglia all’acetil-coA e agisce come un inibitore competitivo dell’acetil-CoA e un inibitore non competitivo dell’ossalacetato. Il citrato inibisce la reazione ed è un esempio di inibizione del prodotto. L’inibizione della citrato sintasi da parte degli analoghi dell’acetil-CoA è stata anche ben documentata ed è stata usata per provare l’esistenza di un singolo sito attivo. Questi esperimenti hanno rivelato che questo singolo sito alterna due forme, che partecipano rispettivamente all’attività di ligasi e idrolasi. Questa proteina potrebbe utilizzare il modello della morfeina di regolazione allosterica.