Začneme úvodem do příslušné biologie a vysvětlíme, co a proč měříme. Poté se zaměříme na dvě hlavní technologie měření: sekvenování nové generace a microarrays. Poté přejdeme k popisu toho, jak se surová data a experimentální informace importují do R a jak používáme třídy Bioconductoru k organizaci těchto dat, ať už vytvořených lokálně, nebo získaných z veřejných repozitářů či institucionálních archivů. Genomické rysy jsou obecně identifikovány pomocí intervalů v genomických souřadnicích a podrobně budou prozkoumány vysoce účinné algoritmy pro výpočty s genomickými intervaly. Statistické metody pro testování hypotéz zaměřených na geny nebo dráhy s daty v genomovém měřítku naleznete v balících, jako je limma, některé z těchto technik budou ilustrovány v přednáškách a laboratořích.
Vzhledem k různorodosti vzdělání našich studentů jsme cyklus rozdělili do sedmi částí. Můžete absolvovat celou sérii nebo jednotlivé kurzy, které vás zajímají. Pokud jste statistici, měli byste zvážit vynechání prvních dvou nebo tří kurzů, podobně pokud jste biologové, měli byste zvážit vynechání některých úvodních biologických přednášek. Všimněte si, že obtížnost statistiky a programování v prvních třech kurzech poměrně rychle narůstá. Ve třetím kurzu se budou vyučovat pokročilé statistické koncepty, jako jsou hierarchické modely, a ve čtvrtém pokročilé dovednosti softwarového inženýrství, jako jsou paralelní výpočty a koncepty reprodukovatelného výzkumu.
Tyto kurzy tvoří dva profesní certifikáty a jsou samostudijní:
Data Analysis for Life Sciences:
- PH525.1x: Statistika a R pro vědy o živé přírodě
- PH525.2x: Úvod do lineárních modelů a maticové algebry
- PH525.3x: Statistical Inference and Modeling for High-throughput Experiments
- PH525.4x: Analýza vysokorozměrných dat
Genomická analýza dat:
- PH525.5x: Úvod do Bioconductoru
- PH525.6x: Případové studie z funkční genomiky
- PH525.7x:
Tato třída byla částečně podpořena grantem NIH R25GM114818.
HarvardX vyžaduje, aby osoby, které se zapisují do jeho kurzů na edX, dodržovaly podmínky čestného kodexu edX. V reakci na porušení kodexu cti edX přijme společnost HarvardX příslušná nápravná opatření, která mohou zahrnovat propuštění z kurzu HarvardX; odebrání všech certifikátů obdržených za kurz HarvardX; nebo jiná nápravná opatření podle okolností. V případě nápravných opatření za takováto porušení nebudou vydávány žádné náhrady. Zapsaní studenti, kteří navštěvují kurzy HarvardX v rámci jiného programu, se rovněž řídí akademickými pravidly těchto programů.
HarvardX usiluje o vědu o učení. Tím, že se zaregistrujete jako online student do kurzu HX, se také podílíte na výzkumu učení. Přečtěte si naše prohlášení o výzkumu, kde se dozvíte více.
Harvardova univerzita a HarvardX se zavazují udržovat bezpečné a zdravé vzdělávací a pracovní prostředí, ve kterém nebude žádný člen komunity vyloučen z účasti na našem programu, nebudou mu odepřeny výhody ani nebude vystaven diskriminaci či obtěžování. Od všech členů komunity HarvardX se očekává, že budou dodržovat zásady Harvardu týkající se zákazu diskriminace, včetně sexuálního obtěžování, a podmínky služby edX. Máte-li jakékoli dotazy nebo obavy, kontaktujte prosím [email protected] a/nebo nahlaste svou zkušenost prostřednictvím kontaktního formuláře edX.