Akademické dynastie: poznejte Nussenzweigovy

Děti profesorů se často samy stávají profesory, jak to vysvětlit? Inu, je to prostá věda, jak zjistili edinburští vědci kolem Iana Dearyho a Stuarta Ritchieho v recenzovaném výzkumu: Nejlepším vědeckým důkazem je, že a) anglická politická elita a šlechta jsou mimořádně inteligentní a b) děti z rodin s nízkými příjmy, zejména z rodin přistěhovalců, zvláště těch tmavé pleti, se málokdy dostanou na Oxbridge. Obojí má dobré vědecké důvody.

V tomto ohledu je celkem jasné, proč má překvapivě mnoho profesorů tatínka profesora a někdy také maminku profesorku. Někdy na stejné univerzitě, kde náhodou studoval jejich geneticky nadřazený a IQ obdařený potomek, nebo dokonce na vlastní fakultní katedře. Někdy prostě stačí vyslovit své příjmení a přiznat: ano, ten a ten je skutečně můj táta, máma nebo strýc, a všechny akademické dveře se jako mávnutím kouzelného proutku otevřou.

Moji čtenáři si možná vzpomenou na dva takové příklady. Molekulární biolog David Sabatini z MIT dlouho zastiňoval svého akademického otce Davida Sabatiniho staršího, ve skutečnosti je mladší tak velký a vlivný, že pravděpodobně nikdy nebude muset žádnou práci odvolat, ať se děje, co se děje. Zcela odlišný je případ v USA žijící řecké materiálové vědkyně Kateriny Aifantisové a jejího otce Eliase Aifantise, který je tak zamotaný, že si i tým otrlých psychiatrů nejspíš přestane rvát vlasy.

Následujícím případem je případ rodiny Nussenzweigových, kde přinejmenším pro jednoho ze synů, profesora imunologie na Rockefellerově univerzitě, výzkumníka HIV, člena AAAS a NAS Michela Nussenzweiga, může být „alternativní kariéra“ lepší volbou. Na PubPeeru jsou věci, které to přinejmenším naznačují. Některé z těchto prací publikoval společně se svým bratrem Andre Nussenzweigem, výzkumníkem rakoviny v Národním onkologickém institutu (NCI) při NIH v Bethesdě.

Jejich rodiče byli Ruth a Victor Nussenzweigovi (oba již zemřeli), velmi významní imunologové z Brazílie, kteří v roce 1963 uprchli před fašistickou diktaturou a usadili se na Newyorské univerzitě (Ruth Nussenzweigová v roce 1939 uprchla před nacisty do Rakouska). Jejich syn Michel studoval, vystudoval a celou svou akademickou kariéru budoval na sousední Rockefellerově univerzitě, kde je katedra jeho fakulty pojmenována po jeho dvou slavných učitelích doktorského studia, Zanvilu Cohnovi a Ralphu Steinmanovi. Nyní Michel Nussenzweig pracuje na léčbě COVID-19, v nedávném článku v Nature studuje protilátky neutralizující virus.

Jistě, Nussenzweigův přístup k rekombinaci imunoglobulinů se zatím ukázal jako ohromný úspěch a jeho články byly zatlučeny do časopisů Nature, Cell a Science. Pokud se to podařilo tam, určitě se to podaří i koronaviru, který bude zbit jako nepoddajný recenzent.

Začněme článkem z Michelovy laboratoře, jehož spoluautorem je jeho bratr a odborník na opravy DNA Andre Nussenzweig.

To vypadá jako opakovaně použitý gel a stojí za dvěma různými experimenty, při nichž byly použity dva různé proteinové konstrukty. Možná chyba, kdy někdo také omylem ořízl pásy při chybném kopírování.

Další nehody z Michelovy Rockefellerovy laboratoře, opět s jeho bratrem jako spoluautorem, kde se jeden ze spoluautorů výše uvedeného článku vrací jako první autor zde:

Niklas Feldhahn, Elisabetta Ferretti, Davide F Robbiani, Elsa Callen, Stephanie Deroubaix, Licia Selleri, Andre Nussenzweig, Michel C Nussenzweig The hSSB1 orthologue Obfc2b is essential for skeletogenesis but dispensable for the DNA damage response in vivo The EMBO journal (2012) doi: 10.1038/emboj.2012.247

Niklas Feldhahn nyní přednáší na Imperial College London. V roce 2006 byla jeho doktorská práce z Kolínské univerzity v Německu (Feldhahn et al JEM 2002) stažena kvůli „nesprávným kompenzacím přístrojů FACS“, další Feldhahnova spoluautorská práce, Klein et al JEM 2004, zatím unikla jakýmkoli literárním opravám. Ani Feldhahn, ani nikdo z Nussenzweigů si zatím nenašli čas reagovat. Tento článek Nussenzweigových v Nature by mohl být ještě problematičtější:

Je poměrně jasné, že oba označené pruhy jsou totožné. Může k tomu dojít náhodou nebo omylem? Záleží na tom, jak definujete náhodu nebo omyl, možná jako přistižení při falšování dat? Tentokrát je to Andre Nussenzweig, který je zde posledním a korespondujícím autorem. Ale ani jeden z bratrů zatím na PubPeeru neodpověděl, přestože jsou především odpovědnými staršími autory. Možná je v tom nějaký vzorec, všimněte si, že druhý autor onoho článku v Nature z roku 2001 je prvním autorem v Cell z roku 2002:

Tento hlavní autor Rafael Caselas je nyní hlavním výzkumníkem v National Cancer Institute (NCI) při NIH v Bethesdě, kde pracuje Andre Nussenzweig. Caselas publikoval také toto se svým mentorem Michelem Nussenzweigem:

Tento žertík se tomuto článku, navíc v časopise Science a s takovým spolupracovníkem, rozhodně nepovedl. Německý vědec Klaus Rajewsky, narozený v roce 1936, je legendárním titánem genetiky a imunologie, jeho jméno otevírá všechny akademické dveře a brány časopisů. Jen tak na okraj, jeho syn Nikolaus Rajewsky se v genetice také docela dobře uplatnil, jak už to u akademických dynastií chodí, všechno je to genetická dědičnost IQ, znáte to. Otec a syn Rajewští opravili v roce 2017 svůj společný článek v časopise Cell Xiao et al 2007, a to kvůli „duplikaci FACS plot“. Situace se zdá být poněkud podobná situaci v článku Caselas et al 2001, protože Rajewští v opravě vysvětlili:

„Malé rozdíly procent ve dvou panelech vpravo jsou způsobeny aktualizací softwaru FlowJo.“

Doufám, že Rajewští ty zlobivé tvůrce softwaru FlowJo zažalovali nebo alespoň tu zlou aktualizaci smazali. Každopádně rozhodně není příjemné nacházet v pracích Klause Rajewského důkazy o falšování dat, zvláště když v roce 2006 došlo k již zmíněnému odvolání s Feldhahnem z Kolína nad Rýnem, který v té době již odjel do USA pracovat s Michelem Nussenzweigem.

V dalším společném článku Michela Nussenzweiga a Klause Rajewského však Feldhahn ani Caselas nejsou:

Yair Dorsett, Kevin M. McBride, Mila Jankovic, Anna Gazumyan, To-Ha Thai, Davide F. Robbiani, Michela Di Virgilio, Bernardo Reina San-Martin, Gordon Heidkamp, Tanja A. Schwickert, Thomas Eisenreich, Klaus Rajewsky, Michel C. Nussenzweig MicroRNA-155 potlačuje aktivační translokaci Myc-Igh zprostředkovanou cytidindeaminázou Immunity (2008) doi: 10.1016/j.immuni.2008.04.002

Špatnou zprávou je, že obrázky se liší jasem/kontrastem, zatímco zobrazují naprosto stejný sken gelu, každý bod pozadí se shoduje. Proč by někdo upravoval jas při náhodném kopírování obrázku? Dobrá zpráva je, že společností vydávaný Journal of Immunology je tak trochu továrna na podvody, která nechává proklouznout mnohem horší věci, než je tato, pro mnohem méně důležité lidi.

Vraťme se však krátce ke zlému softwaru průtokové cytometrie, který vyrábí různá čísla pro identické grafy FACS. Protože právě to se zde muselo stát:

První autor Dimitris Skokos se prosadil ve farmaceutickém průmyslu a je adjunktem na Rockefellerově univerzitě. Školil se tam u stejného mentora jako Michel Nussenzweig, zřejmě je učil nobelista Ralph Steinman, cituji:

„Udělejte vše pro to, abyste uskutečnili svůj první vědecký postřeh. Nikdy neposlouchejte lidi bez představivosti. Prostě se snažte.“

Někteří Steinmanovi svěřenci zřejmě vzali jeho radu příliš doslova.

Dalším případem je jen identicky zduplikovaný obrázek, který sám o sobě mnoho neznamená. Ale zdá se, že takové nebo ještě horší věci se v laboratoři Michela Nussenzweiga na Rockefellerově univerzitě opakovaně stávají náhodou.

Sergey Yurasov , Hedda Wardemann, Johanna Hammersen, Makoto Tsuiji, Eric Meffre, Virginia Pascual, Michel C. Nussenzweig Defective B cell tolerance checkpoints in systemic lupus erythematosus The Journal of Experimental Medicine (2005) doi: 10.1084/jem.20042251

A nyní článek bez Michela, ale s Andre Nussenzweigem. Který se z nějakého důvodu rozhodl, že zde nebude opravovat literaturu:

Longyue L. Cao, Xioaling Xu, Samuel F. Bunting, Jie Liu, Rui-Hong Wang, Longyue L. Cao, J. Julie Wu, Tie-Nan Peng, Junjie Chen, Andre Nussenzweig, Chu-Xia Deng, Toren Finkel A selective requirement for 53BP1 in the biological response to genomic instability induced by Brca1 deficiency Molecular Cell (2009) doi: 10.1016/j.molcel.2009.06.037

Redaktoři Molecular Cell jsou na PubPeeru citováni z více než 2 roky starého článku: „It was investigated and handled according to our Process for Post Publication Issues“. Do dnešního dne nebyla v souvislosti s tímto článkem přijata žádná opatření. Poslední autor, Toren Finkel z University of Pittsburgh, má na Pubpeeru několik článků, jedna taková publikace z jeho laboratoře (Narayan et al Nature 2012) byla stažena, oficiálně pro nereprodukovatelnost.

Bylo opravdu nutné, aby se bratři Nussenzweigové stali vědci jako jejich rodiče, s takovým přístupem k integritě dat? Proč ano, samozřejmě, přesně takhle postupuje biomedicína od jednoho článku v Nature k dalšímu grantu NIH. A přesně takhle bude Michel Nussenzweig léčit COVID-19, pomocí článků z Nature.

.