CAZy

Tento článek se týká databáze. Pro obec ve Spojených státech viz Cazy, West Virginia.

CAZy je databáze sacharidově aktivních enzymů (CAZymes). Databáze obsahuje klasifikaci a související informace o enzymech zapojených do syntézy, metabolismu a rozpoznávání komplexních sacharidů, tj. disacharidů, oligosacharidů, polysacharidů a glykokonjugátů. V databázi jsou zahrnuty rodiny glykosidových hydroláz, glykosyltransferáz, polysacharidových lyáz, sacharidových esteráz a nekatalytických modulů vázajících sacharidy. Databáze CAZy zahrnuje také klasifikaci redoxních enzymů s pomocnou aktivitou, které se podílejí na rozkladu lignocelulózy.

CAZy

Database.png

Obsah

Popis

báze sacharidově aktivních enzymů

Kontakt

Výzkumné centrum

AFMB, Francouzské národní centrum pro vědecký výzkum

Laboratoř

Glykogenomická skupina

Primární citace

Lombard & al. (2014)

Přístup

Webové stránky

http://www.cazy.org/

Nástroje

Web

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZy byla založena v roce 1999 s cílem poskytnout online a neustále aktualizovaný přístup ke klasifikaci rodin CAZymů na základě sekvence proteinů, která byla původně vyvinuta na počátku 90. let 20. století za účelem klasifikace glykosidových hydroláz. Nové záznamy jsou přidávány krátce poté, co se objeví v denních verzích GenBank. Rychlý vývoj vysoce výkonného sekvenování DNA vedl k pokračujícímu exponenciálnímu růstu databáze CAZy, která nyní zahrnuje stovky tisíc sekvencí. Databázi CAZy nadále spravuje a rozvíjí skupina pro glykogenomiku při AFMB, výzkumném centru přidruženém k francouzskému Národnímu centru pro vědecký výzkum a univerzitě v Aix-Marseille.

Databáze CAZy je spojena s databází CAZypedia, která byla spuštěna v roce 2007 jako encyklopedie CAZymů řízená výzkumnou komunitou a založená na wiki.

.

Napsat komentář