Centimorgan (zkráceně cM, pojmenovaný podle Thomase Hunta Morgana) je pomocná měrná jednotka v genetice, která udává frekvenci nebo pravděpodobnost rekombinace v procentech. Tímto způsobem lze kvantifikovat genetickou vzdálenost, tj. genetickou vzdálenost mezi dvěma lokusy na chromozomu.
Geny umístěné na stejném chromozomu lze „rozpojit“ křížením. Očekávaný počet těchto křížení lze odhadnout z (pozorované) frekvence rekombinace.
Dva lokusy jsou od sebe vzdáleny 1 cM, pokud rekombinace (tj. pravděpodobnost křížení mezi těmito lokusy je 1 % na meiózu, tj. v průměru dojde k jednomu křížení na 100 meióz:
R e k o m b i n a c e = 100 ⋅ R e k o m b i n a c e {\displaystyle \mathrm {rekombinace\,} =100\cdot {\frac {\mathrm {počet\;z\;rekombinantní\;gamety} }{\mathrm {gamety;celkem} }} 
(pro vznik zygoty je třeba dvou gamet, při vzniku každé z nich mohlo dojít k rekombinaci).