Ředitel HealyEdit
V roce 2014 odstoupil Jerry Healy, ředitel Charlotte Catholic, uprostřed spekulací, že zpronevěřil peníze z fondu zřízeného na pomoc rodinám s nižšími příjmy, aby mohly posílat své děti do školy. V roce 2015 se Healy přiznal k tomu, že během sedmi let ukradl škole i fondu více než 160 000 dolarů. Prokuratura sice navrhovala podmíněný trest bez opatření vzít ho do vazby, ale v dubnu 2016 americký okresní soudce Frank Whitney Jr. odsoudil Healyho ke třem měsícům v domě na půl cesty. Až do této chvíle byl Healy známým a oblíbeným členem komunity katolického školského systému, neboť více než deset let působil jako ředitel Charlotte Catholic a 44 let úzce spolupracoval s diecézí.
Žaloba Lonnieho BillardaEdit
Dne 11. ledna 2017 podnikl Lonnie Billard kroky k žalobě na Charlotte Catholic High School z důvodu diskriminace. Billard tvrdí, že přišel o místo učitele na katolické škole kvůli tomu, že oznámil svatební plány své dlouholeté partnerky. Federální žaloba obviňuje CCHS, Meckenburg Area Catholic Schools a římskokatolickou diecézi Charlotte z nezákonné diskriminace jeho osoby kvůli jeho sexuální preferenci. Billard byl předtím v roce 2012, kdy byl plně zaměstnán v katolické škole, oceněn titulem Učitel roku, a to až do své rezignace v témže roce. Dne 25. října 2014, z toho jen několik týdnů před zrušením zákona o manželství osob stejného pohlaví v Severní Karolíně, Billard zveřejnil na Facebooku své svatební oznámení. V žalobě se uvádí, že na Štědrý den byl propuštěn jako suplent v CCHS. Dne 9. ledna 2015 Billard informoval Charlotte Media o svém propuštění z katolické školy. Několik právních ředitelů se shodlo na tom, že i když se jedná o nábožensky spřízněnou školu, nemá žádné právo odmítnout hlavu VII zákona o občanských právech z roku 1964. Stížnost, kterou vyplnila státní pobočka Americké unie občanských svobod, deklaruje vrácení mzdy, benefitů, sankční škody, odškodnění za citové strádání, soudní příkaz, který by škole a vedení katolíků zakázal podobné jednání v budoucnu, a vrácení jeho místa suplujícího učitele. Diecéze odmítla vydat prohlášení pro média týkající se těchto událostí, protože případ stále probíhá.
Projev sestry Jane DominicEdit
Dne 21. března 2014 Charlotte Catholic přivítala sestru Jane Dominic Laurel, dominikánskou jeptišku vyškolenou na Papežské univerzitě, aby přednesla projev o katolickém přesvědčení o genderových rolích. Během projevu sestra Jane Dominic naznačila, že masturbace a pornografie mohou vést mladé dospělé k homosexualitě a že děti vychovávané v neúplných rodinách mají větší pravděpodobnost, že z nich vyrostou homosexuálové. Studenti ani rodiče nebyli o obsahu jejího projevu předem informováni. Internetová petice proti obsahu jejího projevu, kterou sepsala absolventka Charlotte Catholic Emma Winters(c/o 2014), získala 2000 podpisů a byla zahájena kampaň na psaní dopisů diecézi Charlotte a Konferenci katolických biskupů USA. Krátce poté byla sepsána protipetice tehdejším studentem Charlotte Catholic Jackem Dentonem, který se později zapojil do kontroverzní žaloby za náboženskou svobodu na Floridské státní univerzitě, (c/o 2017), která hájila důstojnost sestry Jane Dominic Laurel, neboť ta se po její přednášce stala terčem útoků. Získala více než 2500 podpisů. Setkání rodičů, které střední škola uspořádala později v týdnu k diskusi o projevu, přilákalo téměř tisíc lidí a setkání trvalo o více než hodinu déle, než bylo plánováno, kvůli množství rodičů, kteří chtěli klást otázky nebo vznášet připomínky. Projevu a jeho následkům věnovala pozornost celostátní média. Diecéze Charlotte a biskup Peter Jugis nadále podporovali učení sestry Jany Dominiky a katolická média ji energicky podporovala. Začátkem dubna sestra Jane Dominicová zrušila všechny své plánované přednáškové akce a vzala si dovolenou z pozice učitelky na Aquinas College. Prezident Aquinas College uvedl, že sestra Jane Dominic ve svém projevu „jasně hovořila o otázkách víry a morálky“, ale „její odklon do oblastí sociologie a antropologie byl nad rámec jejích odborných znalostí“.
VapingEdit
Dne 17. listopadu 2017 Charlotte Catholic oznámila, že disciplinární opatření budou zahrnovat zákaz vapovacích zařízení a dopisy byly v této věci rozeslány domů. Používání těchto zařízení vedlo k vyloučení „hrstky“ studentů.
ZaměstnanecEdit
V březnu 2018 Charlotte Catholic propustila zaměstnance školy poté, co se dva studenti ve věku 16 až 17 let přihlásili s nevhodnými textovými rozhovory.
Propuštění sestry AgnesEdit
Dne 17. května 2020 nebyla prodloužena smlouva sestry Agnes, členky teologického oddělení v Charlotte Catholic. Petice vytvořená studenty shromáždila tisíce podpisů požadujících zrušení tohoto rozhodnutí.