Kirk žije s režisérem Neilem Marshallem v Los Angeles. Jako mladé dívce jí byl diagnostikován Aspergerův syndrom.
Kirk se zapletla do několika afér s manažery televizních a filmových studií. V březnu 2019 byla Kirková spojována s rezignací generálního ředitele společnosti Warner Bros Kevina Tsujihary.
…Kirková údajně začala kontaktovat Tsujiharu, Packera a Ratnera a tlačit na ně, aby jí zajistili role v připravovaných filmech. Kirkova snaha nevedla k ničemu podstatnému, ale získala malé role v produkci Warner Bros „Ocean’s 8“ a v produkci New Line Cinema „How to Be Single“. Když v roce 2019 vyšly Tsujiharovy činy najevo, nezbylo mu než odstoupit… Kirk údajně také tlačil na generálního ředitele společnosti Millennium Films Aviho Lernera, aby získal role v jeho produkcích, včetně remaku filmu „Hellboy“ režiséra (Neila) Marshalla z roku 2019.“ -Variety
Potvrzuji, že jsem v létě 2013 udržoval romantický vztah s Jamesem Packerem a že se mnou pan Packer jednal s respektem a nemám s ním žádné problémy ani vůči němu žádné nároky. Dále potvrzuji, že po ukončení vztahu jsem vyhledala radu pana Tsujihary, se kterým mě seznámil pan Packer. Pan Tsujihara mi nikdy nic neslíbil. Potvrzuji také, že mi Brett Ratner pomáhal z přátelství, aby mi pomohl získat konkurzy a snažil se mi pomoci najít agenta, a nemám s ním žádné problémy ani vůči němu žádné nároky. Popírám, že by mezi mnou a Brettem Ratnerem byla v roce 2016 uzavřena jakákoli právní dohoda nebo vyrovnání.“
-Charlotte Kirk, (Vanity Fair)
V roce 2012 se tehdy dvacetiletá Kirk zapletla s tehdejším místopředsedou představenstva společnosti NBCUniversal Ronaldem Meyerem, tehdy šedesátiletým, při setkání na akci Hollywood Foreign Press Association v Londýně. Koncem roku 2012 měl Kirk sexuální vztah s australským miliardářem Jamesem Packerem.
Kirk měl v letech 2013 a 2014 mimomanželský poměr s tehdejším generálním ředitelem společnosti Warner Bros Kevinem Tsujiharou. Tsujihara odstoupil z funkce generálního ředitele společnosti Warner Bros. v březnu 2019.
V srpnu 2020 byla spojována s odstoupením Meyera. Meyer prozradil, že Kirkové vyplatil vyrovnání ve výši 2 milionů dolarů.
V září 2020 časopis The Hollywood Reporter odhalil, že Tsujihara a Meyer se možná domluvili, aby zakryli skutečnou povahu svých vztahů s Charlotte Kirkovou.
Dne 29. října 2020 časopis Vanity Fair zveřejnil článek „Sex and Texts, Secrets and Lies: How the Charlotte Kirk Saga Blew Up Hollywood“ od Marka Seala. Článek podrobně popisuje složitý příběh zapletení paní Kirkové na různých úrovních s několika hollywoodskými manažery a producenty.