Známky a příznaky mírného cinchonismu (které se mohou objevit při standardních terapeutických dávkách chininu) zahrnují zarudlou a zpocenou kůži, zvonění v uších (tinnitus), rozmazané vidění, zhoršení sluchu, zmatenost, reverzibilní vysokofrekvenční ztráta sluchu, bolest hlavy, bolest břicha, vyrážka, lichenoidní reakce vyvolaná lékem (lichenoidní fotosenzitivita), závrať, točení hlavy, nevolnost, zvracení a průjem.
Velké dávky chininu mohou vést k závažným (ale reverzibilním) příznakům cinchonismu: kožní vyrážka, hluchota, somnolence, snížená zraková ostrost nebo slepota, anafylaktický šok a poruchy srdečního rytmu nebo vedení a smrt v důsledku kardiotoxicity (poškození srdce). Chinin může také u pacientů s malárií vyvolat vzácnou formu reakce z přecitlivělosti, označovanou jako horečka černé vody, která vede k masivní hemolýze, hemoglobinémii, hemoglobinurii a selhání ledvin. Většina příznaků chinonismu (s výjimkou závažných případů) je reverzibilní a vymizí po vysazení chininu. Pokus o sebevraždu požitím velké dávky chininu způsobil ireverzibilní tunelové vidění a velmi těžké poškození zraku.
Pacienti léčení chininem mohou také trpět nízkou hladinou cukru v krvi, zejména pokud je podáván intravenózně, a hypotenzí (nízkým krevním tlakem).
Chinin, stejně jako chlorochin, inaktivuje enzymy v lysozomech buněk a má protizánětlivý účinek, proto se používá při léčbě revmatoidní artritidy. Inaktivace těchto enzymů však může také způsobit abnormální hromadění glykogenu a fosfolipidů v lysozomech, což způsobuje toxickou myopatii. Je možné, že toto působení je hlavní příčinou cinchonismu
.