V roce 2003 zažalovali investoři společnosti Lancer Group společnost Citco za údajné vědomé šíření „zavádějících“ prohlášení o čisté hodnotě aktiv (NAV). Společnost Citco nakonec informovala investory, že se vzdává funkce správce fondů Lancer, ale neposkytla žádné vysvětlení. Společnost Citco sice poukazovala na skutečnost, že si vyžádala vyjádření představenstva společnosti Lancer ohledně správnosti ocenění, soudkyně Shira Scheindlinová však napsala: „Ačkoli tyto kroky prokazují zpochybňování čísel ze strany společnosti Citco Group, lze je také interpretovat jako snahu společnosti Citco Group zakrýt vlastní zapojení do procesu.“ Společnost Citco se nakonec s investory dohodla na vyrovnání.
V roce 2013 zažalovaly tři louisianské penzijní systémy, které investovaly 100 milionů dolarů do hedgeového fondu slibujícího vysoké výnosy při nízkém riziku, společnost Citco, která obchod spravovala. Žaloba tvrdila, že společnost Citco sdělila správcům penzijních fondů, že jejich investice získává na hodnotě, ačkoli to nebyla pravda, neboť společnost Citco uvedla investory v omyl ohledně skutečné hodnoty aktiv investice.
V březnu 2015 podali Roger Corman a jeho manželka žalobu na společnost Citco, v níž uvedli důvody žaloby včetně porušení fiduciární povinnosti, podvodu, uvedení v omyl a bezdůvodného obohacení s tím, že kvůli nevhodnému jednání a nečinnosti společnosti Citco, správce fondu, nakonec přišli až o 60 milionů USD.
Investoři skupiny Fairfield Greenwich, největšího provozovatele „napájecích fondů“ Ponziho schématu Bernarda Madoffa, podali žalobu proti společnosti Citco ve věci Anwar v. Fairfield Greenwich u okresního soudu USA, jižní obvod New York, u soudkyně Shiry Scheindlin. Investoři tvrdili, že společnost Citco byla povinna nezávisle vypočítat čistou hodnotu aktiv fondů a poskytnout tato čísla podílníkům, ale místo toho: Společnost Citco se při výpočtu a šíření NAV fondů „slepě a lehkomyslně spoléhala na informace poskytnuté Madoffem a fondy…, přestože tyto informace byly zjevně chybné“. Společnost Citco byla obviněna z toho, že řádně nesledovala a nehodnotila investice společnosti Fairfield Greenwich, z nichž více než 7 miliard USD bylo zasláno společnosti Bernard L. Madoff Investment Securities LLC. Investoři uvedli, že v důsledku podvodu a nedbalosti společnosti Citco utrpěli velké ztráty, jakmile byl v prosinci 2008 odhalen Madoffův Ponziho systém. V srpnu 2015 společnost Citco souhlasila se zaplacením 125 milionů dolarů za urovnání tvrzení, že uvedla investory v omyl, když investovali do společnosti Fairfield Greenwich Group. Jednalo se o největší vyrovnání se správcem nebo uschovatelem v souvislosti s Madoffovým podvodem.