V průběhu služby u námořnictva USA, pobřežní stráže USA a námořnictva Vietnamské republiky byly na fregatách třídy Andrés Bonifacio provedeny změny oproti původnímu návrhu. Lodě byly filipínskému námořnictvu předány s menším počtem zbraní na palubě a starými radary pro vyhledávání na hladině, což filipínské námořnictvo později řešilo modernizačními programy, včetně přidání přistávací plochy pro vrtulníky v roce 1979.
Primární zbraní Andrése Bonifacia bylo jediné dělo Mk. 12 ráže 5 palců/38 mm (127 mm). Byl namontován v uzavřeném základním prstenci Mark 30 Mod 0 a měl dostřel až 18 200 yardů (16 600 m) metrů. Dělo bylo dvouúčelového typu, schopné vést protizemní i protiletadlový boj. Dále nesla dvě zdvojená protiletadlová děla Mk. 1 Bofors 40 mm L/60 a dvě jednoduchá protiletadlová děla Bofors 40 mm L/60, čtyři zdvojená 20mm děla Oerlikon, čtyři kulomety M2 Browning ráže .50 (12,7 mm) pro všeobecné použití a dva minomety ráže 81 mm.
Instalovaný radarový systém zahrnuje navigační radar Sperry AN/SPS-53 pro vyhledávání na hladině &, který nahradil dříve instalovaný AN/SPS-23, a zároveň si ponechal oba radary AN/SPS-29D pro vyhledávání ve vzduchu a Mk.26. Mod.1 Fire Control Radar System.
Hatch and Kirk, Inc, přidala v roce 1979 na záď vrtulníkovou palubu. Ačkoli loď neměla žádné trvale přidělené letouny a nemohla poskytovat servis pro hostující vrtulníky, vrtulníková paluba mohla pojmout hostující vrtulník MBB Bo 105C, používaný filipínským námořnictvem pro užitkové, průzkumné a námořní hlídkové účely.
Lodě poháněly dva dieselové motory Fairbanks-Morse 38D o kombinovaném výkonu přibližně 6 200 brzdných koňských sil (4,63 megawattů) pohánějící dvě vrtule. Hlavní motory mohly pohánět loď o výtlaku 1 766 tun (standardní zatížení) maximální rychlostí přibližně 18 uzlů (33 km/h). Loď měla maximální dosah 8 000 námořních mil (14 820 km) při ekonomické rychlosti 15,6 uzlu (29 km/h).
Filipínské námořnictvo plánovalo modernizaci celé třídy lodí novými radarovými systémy a protilodní řízenou střelou dlouhého doletu BGM-84 Harpoon, která se však neuskutečnila kvůli zhoršující se politické a ekonomické krizi ve Filipínské republice v polovině 80. let.
.