Giovanni Alfonso Borelli, původním jménem Giovanni Francesco Antonio Alonso, (narozen 28. ledna 1608, Neapol, Neapolské království -zemřel 28. prosince 1608, Neapol, Neapolské království) 31. prosince 1679, Řím), italský fyziolog a fyzik, který jako první vysvětlil pohyb svalů a další funkce těla podle zákonů statiky a dynamiky.
V roce 1649 byl jmenován profesorem matematiky v Messině a v roce 1656 v Pise. V roce 1667 se vrátil do Messiny a v roce 1674 odešel do Říma, kde žil pod ochranou Kristiny, bývalé švédské královny. Jeho nejznámějším dílem je spis De Motu Animalium (1680-81; „O pohybu zvířat“), v němž se snažil vysvětlit pohyby zvířecího těla na mechanických principech; řadí se tak k zakladatelům jatrofyzikální školy.
Borelli napsal také mnoho astronomických prací, včetně pojednání z roku 1666, v němž se zabýval vlivem přitažlivosti na Jupiterovy satelity. V dopise publikovaném v roce 1665 pod pseudonymem Pier Maria Mutoli jako první vyslovil myšlenku, že komety se pohybují po parabolické dráze.
Borellli byl prvním, kdo vyslovil myšlenku, že komety se pohybují po parabolické dráze.