Kapsomera je podjednotka kapsidy, vnějšího bílkovinného obalu, který chrání genetický materiál viru. Kapsomery se samy shromažďují a tvoří kapsidu.
Na tomto schématu adenoviru jsou jasně patrné molekuly kapsidy.
Podjednotky nazývané protomery se shlukují a tvoří kapsomery. Různá uspořádání kapsomer jsou následující: 1) ikosaedrické, 2) šroubovicové a 3) komplexní.
1) Ikosaedrické – ikosaedr je mnohostěn s 12 vrcholy a 20 stěnami. Ikosahedrální kapsomery tvoří dva typy kapsomer: pentagonální (pentony) ve vrcholech a hexagonální (hexony) na stěnách. Pentonů je vždy dvanáct, ale počet hexonů se u jednotlivých skupin virů liší. Na elektronových mikrofotografiích jsou kapsomery rozpoznatelné jako pravidelně rozmístěné prstence s centrálním otvorem.
2) Šroubovicové – protomery nejsou seskupeny v kapsomerách, ale jsou k sobě vázány tak, že tvoří stužkovitou strukturu. Tato struktura se skládá do šroubovice, protože protomery jsou na jednom konci silnější než na druhém. Průměr šroubovice kapsidy je dán vlastnostmi jejích protomerů, zatímco její délka je dána délkou nukleové kyseliny, kterou uzavírá.
3) Komplexní – např. takový, jaký vykazují poxvirus a rhabdovirus. Tato skupina zahrnuje všechny viry, které nepatří do žádné z předchozích dvou skupin. když virová částice pronikne do hostitelské buňky, hostitelské buněčné enzymy stráví kapsidu a její složky kapsomery, čímž odhalí holý genetický materiál (DNA/RNA) viru, který následně vstoupí do replikačního cyklu.
Kapsomery chrání před fyzikálním, chemickým a enzymatickým poškozením a jsou multiplicitní; mají několik proteinových podjednotek, které se opakují. Je to proto, že virový genom se chová co nejúsporněji tím, že k vytvoření velké struktury potřebuje jen několik proteinových kodonů. Jednou z hlavních funkcí kapsidy je vnášet uzavřený virový genom do hostitelských buněk tím, že se snadno adsorbuje na povrch hostitelské buňky.
.