Alternativní protokoly léčby rakoviny využívají vysokodávkovanou enzymoterapii k rozkladu nádorů, vyčištění oběhového systému od nečistot a stimulaci imunitních funkcí. Systémové enzymy používané v těchto protokolech rozkládají ochranný obal virů a uvolňují je tak, aby mohly být identifikovány a napadeny imunitním systémem. Viry a další patogenní mikroorganismy výrazně zvyšují toxickou zátěž a zatěžují imunitní systém. Eliminace těchto infekcí je pro optimální funkci imunitního systému nanejvýš důležitá.
Tentýž proces platí i pro rakovinné buňky. Když je fibrin rozložen, imunitní systém je pak schopen účinněji zasáhnout patogenní vetřelce. Enzymy také zvyšují funkci imunitního systému tím, že stimulují imunitní molekuly, jako jsou cytokiny, makrofágy a přirozené zabíječské buňky. Když imunitní systém pracuje na plné obrátky, může se věnovat svým povinnostem, tj. bránit růstu a šíření rakoviny.
Systémové enzymy zvyšují účinnost konvenční léčby rakoviny, jako je chemoterapie a ozařování. Chemoterapie je schopna lépe zasáhnout rakovinné buňky, když je fibrin rozložen, a lze použít nižší dávky. Díky svým protizánětlivým a analgetickým účinkům jsou enzymy užitečné při zmírňování negativních vedlejších účinků chemoterapie, jako je zvracení, bolest, ochabování svalů a vyčerpání. Enzymy jsou také užitečné při odbourávání zjizvené tkáně, což je vedlejší účinek ozařování. Kromě toho se pacienti při užívání enzymů rychleji zotavují po operaci.