VYUŽITÍ SOFTWARU PRO SPRÁVU BIBLIOGRAFICKÝCH ODKAZŮ PŘI VÝBĚRU PRIMÁRNÍCH STUDIÍ V INTEGRATIVNÍCH PŘEHLEDECH

VYUŽITÍ VÝSLEDKŮ HLEDÁNÍ PRIMÁRNÍCH STUDIÍ

Využití softwaru pro správu bibliografických odkazů bylo původně navrženo pro systematické přehledy (SR) studií, přičemž první publikace o využití tohoto systému pocházejí z 90. let 20. století.17-18 Mnoho recenzentů používá tabulky Microsoft Excel, zatímco jiní vybírají studie ručně, s tiskem názvů a abstraktů, což činí tento proces složitým, neekologickým a časově náročným. V současné době je pracovní postup při recenzním řízení zefektivněn používáním počítačových programů.19 Ve studii publikované v roce 2013 autoři poukázali na to, že více než polovina systematických přehledů používá software EndNote®.20 Vzhledem k tomu, že SR jsou podobné IR, nabízí se použití této technologie s cílem usnadnit proces výběru primárních studií.

Používání programů pro správu bibliografických referencí (např. EndNote®, Mendeley® a Zotero®) je důležité pro operacionalizaci výběru primárních studií v IR.13 Tyto programy umožňují vyhledávat opakované reference, identifikovat jazyky, vybírat období publikování, vytvářet skupiny podle kritérií výběru (zařazení a vyloučení), porovnávat vybrané reference mezi recenzenty a také vytvářet citace při psaní vědeckého textu, což usnadňuje formátování referencí na konci každého procesu přípravy rukopisu. Výběr softwaru je ovlivněn jeho dostupností (bezplatný nebo placený) a přizpůsobením se recenzenta dostupným možnostem. V literatuře existují studie, v nichž autoři porovnávali různé programy.21-22 Obecně lze říci, že referenční manažery plní základní funkce vyhledávání publikací, ukládání výsledků a citování odkazů při psaní rukopisu.

Výběr programu by však měl odpovídat individuálním potřebám recenzenta, protože každý nástroj má své výhody i nevýhody.21-22 Například snadné používání programu Mendeley® je jednou z jeho silných stránek. Na druhou stranu má tento manažer tu slabinu, že neumožňuje vyhledávání v databázích v rámci vlastní struktury, ani neumožňuje dynamické změny ve formátování citací v textech.22 Je tedy nutné znát jednotlivé softwary a určit ten, který se nejlépe přizpůsobí každému recenzentovi, a proto stojí za zmínku používání programu EndNote®, který autoři tohoto článku používají již více než 15 let.

V této úvaze se budeme zabývat používáním programu EndNote®, verze XV. Je třeba poznamenat, že na webových stránkách společnosti Thomson Reuters (www.endnote.com) je k dispozici bezplatná online verze (EndNote® Basic), která nemá všechny funkce dostupné v placené verzi.

Při vytváření souboru v EndNote® lze také načrtnout různé skupiny za účelem uspořádání vyhledávání. Po prohledání primárních studií v databázích, v nichž recenzent zkřížil řízené deskriptory a klíčová slova ze strategie PICO, lze rešerši snadno exportovat do souboru a importovat pomocí filtrů pro EndNote®. Například vyhledávání v databázi PubMed vyžaduje výběr filtru „PubMed (NLM)“; v databázi LILACS je vhodným filtrem „Reference Manager (RIS)“. Jiné databáze, například CINAHL a Web of Science, umožňují přímý import referencí poklepáním na soubor exportovaný z databáze. EndNote® poskytuje svým uživatelům kanál YouTube s různými videi, která učí, jak tento software používat (https://www.youtube.com/user/EndNoteTraining). Kromě toho jsou uživatelům k dispozici bezplatné, uživatelsky přívětivé příručky.

Po importu rešerše do EndNote® a nasměrování záznamů odkazujících na skupinu, která označuje jednotlivé databáze, se doporučuje uložit záložní soubor s původní rešerší, bez správy obsahu, za účelem vyhledání publikací, které mohly být uživatelem neúmyslně vyloučeny, kromě toho, že je k dispozici záznam o počtu referencí identifikovaných v každé databázi.

Další funkcí je změna (nebo přizpůsobení) dostupných polí v knihovně EndNote® pro identifikaci zdroje každé rešerše. Uživatel musí vybrat „Nástroje“, kliknout na „Změnit a přesunout pole“, vybrat pole, například „URL“, vybrat „Nahradit celé pole s“, v pravém rámečku zadat název databáze, ke které se skupina exportovaných referencí vztahuje, a kliknout na „OK“. Tato akce změní celý obsah sloupce referencí pro danou skupinu. Po provedení této změny v každé databázi bude mít recenzent k dispozici přesný záznam zdroje každé reference. Toto by měl být jeden z prvních kroků, které recenzent provede. Krok za krokem pro popsanou funkci a další důležité příkazy pro provádění přehledových metod je k dispozici na kanálu YouTube „EndNote for Systematic Reviews „*.

Obrázek 2 představuje příklad vytvoření skupin v databázi referencí při tvorbě přehledových metod. K tomu stačí kliknout pravým tlačítkem myši v rámci „My Groups“ (Moje skupiny), kde můžete vytvářet sady skupin („Create Group Set“ (Vytvořit sadu skupin)) a v rámci každé větší skupiny nové skupiny („Create Group“ (Vytvořit skupinu)). Tyto akce umožňují vytvářet různé filtrace ze souboru identifikovaných primárních studií. Pro přidání referencí do jednotlivých skupin stačí vybrat publikaci a přetáhnout ji do požadované skupiny.

Používání EndNote® rovněž umožňuje měnit pole v rámci referenční báze, aby bylo možné spravovat kritéria zařazení a vyloučení, která prováděli nezávislí recenzenti. V tomto případě dostane každá reference označení s jedním nebo více kódy, které odůvodňují zařazení nebo vyloučení primární studie každým recenzentem. V literatuře, v publikované studii, autoři vypracovali návod, jak používat funkce EndNote® , které umožňují důsledný a organizovaný výběr primárních studií.23

Při výběru primárních studií by se měly odkazy opakovat (duplicita studií) při vyhledávání v různých databázích. Před odstraněním duplicitních studií je třeba přejmenovat sloupec „URL“ s uvedením databáze z odkazu, jak bylo uvedeno dříve. Jak je znázorněno na obrázku 3, lze vytvořit skupinu s názvem „Duplicitní studie“ a do této složky nasměrovat všechny opakující se reference.

Chce-li recenzent vybrat duplicitní studie, měl by kliknout na horní záložku s názvem „Reference“ a vybrat možnost „Find Duplicates“. Prostřednictvím této akce program zvýrazní duplicitní reference. Dalším krokem je odstranění těchto referencí, což je akce, která duplicitní texty odešle do složky „Unfiled“. Pokud program odešle duplicitní odkazy do softwarového koše, je třeba tyto záznamy znovu vybrat, kliknout pravým tlačítkem myši a vybrat „Obnovit do knihovny“. Tato akce nasměruje obnovené odkazy do složky „Unfiled“, odkud je lze přidat do zájmové složky, jak již bylo uvedeno. Relevantním krokem je vybrat všechny texty přesměrované do složky „Unfield“, kliknout pravým tlačítkem myši a přidat tyto odkazy („Add References To“) do složky, která bude obsahovat duplicitní studie. Je možné, že po provedení tohoto úkonu ještě nějaká duplicitní studie zůstane, protože reference byly získány z různých bází a nejsou vždy indexovány identicky.

Pro výběr roku vydání, například posledních pěti nebo deseti let, by měl recenzent kliknout na sloupec „Year“, který se objeví jako nadpis bezprostředně před referencemi. Kliknutím na tento sloupec program seřadí reference podle roku vydání vzestupně a sestupně. Recenzent může vybrat reference z let, které ho zajímají, a provést stejnou akci, která byla popsána dříve, tj. odstranit reference, které nejsou součástí vymezeného období, a odeslat je do složky „Nevyplněné“. Dále by měl recenzent vybrat všechny texty předané do této složky, kliknout pravým tlačítkem myši a přidat tyto reference („Add References To“) do složky, která bude obsahovat studie publikované v období, které nebylo vybráno pro sestavení vzorku recenze.

Pro účely identifikace jazyka existují dva způsoby. Prvním je vyhledávání v rámci databáze referencí. Recenzent by si měl uvědomit, že po kliknutí na libovolnou složku vytvořených skupin lze vyhledávat v různých polích pomocí nástroje „Search“. Při kliknutí na existující možnosti vyhledávání by měl recenzent vybrat pole „Jazyk“. Po této akci zadejte jazyky, které recenzent neovládá nebo o které nemá zájem. V závislosti na databázi, ze které byla studie získána, může být jazyk podrobně popsán nebo identifikován pomocí počátečních tří písmen, například „eng“ pro identifikaci angličtiny. Může být také prázdný, to znamená, že neobsahuje informaci o jazyce reference.

Druhým způsobem je použít stejný nástroj „Search“, v možnostech vyhledávání vybrat pole „Title“ a zadat symbol závorky „[„, protože většinou reference, které jsou v jiném jazyce než v angličtině, mají v závorkách své názvy v angličtině. Po tomto úkonu by měl recenzent tyto reference odstranit odesláním článků do složky „Unfiled“. Poté vyberte všechny texty předané do této složky, klikněte pravým tlačítkem myši a přidejte tyto reference („Add References To“) do složky, která bude obsahovat reference publikované v jiných jazycích, které nebudou součástí recenzního vzorku.

Pro identifikaci textů, které nejsou vědeckými články, by měl recenzent kliknout na sloupec „Ref Type“, který se objeví jako nadpis bezprostředně před studiemi uvedenými v databázi referencí. Kliknutím na tento sloupec program seřadí reference podle jejich typu, což usnadňuje například identifikaci diplomových prací a kapitol knih.

Další užitečnou funkcí programu je souhrn publikace, který je důležitým aspektem pro výběr primárních studií, které budou zahrnuty do IR, a to přečtením názvu a souhrnu každé reference. Proto se po kliknutí na složku, která vás zajímá, na stejném místě, kde probíhá vyhledávání v samotných referencích, nachází ikona nazvaná „Náhled“, která umožňuje kompletní vizualizaci reference a abstraktu. Všimněte si, že pro toto zobrazení je třeba v horní záložce, kde je možné vybrat styl reference, kliknout na „Anotovaný“, jinak se uživateli zobrazí poslední styl reference použitý pro formátování referencí.

Pro doplnění výhod používání EndNote® obsahuje program také nástroj pro fulltextové vyhledávání. Za tímto účelem by měl recenzent vybrat reference, kliknout pravým tlačítkem myši a zvolit „Najít plný text“. Je třeba poznamenat, že program vyhledává skupiny 250 referencí, takže by tomu měl recenzent věnovat pozornost při vyhledávání textů ve formátu Portable Document Format (PDF). Tato funkce programu je také podmíněna IP adresou počítače, vyhledává větší množství textů v institucích přidružených k výzkumným portálům, nebo když je možný vzdálený přístup mimo akademické prostředí prostřednictvím služby virtuální privátní sítě (VPN).

.