Andrew H. Knoll ist Fisher-Professor für Naturgeschichte an der Harvard University. Er erhielt 1973 seinen B.A. in Geologie von der Lehigh University und 1977 seinen Doktortitel, ebenfalls in Geologie, von Harvard. Nach fünf Jahren an der Fakultät des Oberlin College kehrte er 1982 als außerordentlicher Professor für Biologie nach Harvard zurück. Seitdem ist er Mitglied der Harvard-Fakultät, wo er als Professor für Biologie, Professor für Erd- und Planetenwissenschaften, als Vorsitzender der Abteilung für organismische und Evolutionsbiologie und als stellvertretender Dekan der Fakultät für Kunst und Wissenschaften tätig ist.
Andrew Knolls Forschung konzentriert sich auf die frühe Evolution des Lebens, die Umweltgeschichte des Präkambriums und insbesondere auf die Zusammenhänge zwischen diesen beiden Bereichen. Zu den paläontologischen Entdeckungen seines Labors gehören die Mikrofossilien von Svalbard, aus denen grundlegende Prinzipien der Paläoökologie des Proterozoikums entwickelt wurden, außergewöhnlich gut erhaltene Fossilien aus dem Mesoproterozoikum in Sibirien und Nordaustralien, die einige der ältesten Belege für die eukaryotische Biologie liefern, sowie phosphatierte, verkieselte und komprimierte Fossilien aus der Doushantuo-Formation des Ediacaran in China, die sowohl frühe Tiere als auch eine endzeitliche Strahlung von Algen belegen. Derzeit ist er Mitglied des Wissenschaftsteams für die MER-Mission der NASA zum Mars.
Professor Knoll war Mitglied des Vorstands des National Museum of Natural History (Smithsonian Institution), des United States Board of Earth Science and Resources, des U.S. Space Science Board und des Advisory Council des Jet Propulsion Laboratory in Pasadena, Kalifornien. Er leitete die Unterkommission der International Commission of Stratigraphy, die die Ediacaran-Periode einführte, die erste neue Periode der geologischen Zeitskala, die in mehr als einem Jahrhundert ratifiziert wurde.
Professor Knoll wurde u. a. mit dem Schuchert-Preis der Paläontologischen Gesellschaft, der Walcott-Medaille der Nationalen Akademie der Wissenschaften, der Ehrenmitgliedschaft in der Europäischen Union der Geowissenschaften, dem Phi Beta Kappa Book Award in Science (für sein 2003 erschienenes Buch Life on a Young Planet), der Moore-Medaille der Society for Sedimentary Geology, der Medaille der Paläontologischen Gesellschaft und der Wollaston-Medaille der Geologischen Gesellschaft von London ausgezeichnet. Andrew Knoll ist Mitglied der National Academy of Sciences, der American Academy of Arts and Sciences und der American Philosophical Society.