Las relaciones filogenéticas del género de lagartos sin patas del Paleártico Occidental Anguis se infirieron a partir de un fragmento de ADN mitocondrial y de dos loci nucleares codificadores de proteínas, C-mos y PRLR. Se confirmó que A. cephallonica del Peloponeso es una especie válida. Es el taxón hermano de un clado que comprende todos los demás linajes evolutivos, que se demostró que representan tres especies distintas: (1) A. fragilis sensu stricto, que se encuentra en Europa occidental y central, el noroeste de los Balcanes, con posibles poblaciones aisladas en los Balcanes orientales, y presumiblemente también en el oeste de Escandinavia e Italia; (2) A. colchica, que se distribuye desde el este de la República Checa y la región del Báltico hacia el este hasta el norte de Irán, presumiblemente también en el este de Escandinavia, y el noreste de los Balcanes; (3) A. graeca, restringida al sur de los Balcanes, y parcialmente simpática con A. cephallonica. Según el marcador mitocondrial más variable, A. graeca parece ser la especie hermana de A. colchica, y estos taxones forman juntos un clado hermano de A. fragilis, mientras que los marcadores nucleares menos variables muestran que A. colchica está más cerca de A. fragilis. El gen C-mos no ha proporcionado una variación sustancial dentro de este complejo de especies, mientras que el gen PRLR, que se utilizó por primera vez en un estudio filogeográfico en un reptil, distinguió todas las especies con éxito. Se discute la diferenciación intraespecífica de A. colchica y se propone el estatus subespecífico de las poblaciones del Cáucaso y del Caspio. Las diferencias genéticas descubiertas deben tenerse en cuenta en todos los futuros estudios biogeográficos, morfológicos y ecológicos, así como en la conservación.