| クエン酸（Si）シンターゼ | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 識別記号 | ||||||
| EC番号 | 2.3.3.1 | |||||
| CAS番号。 | 9027-96-7 | |||||
| Databases | ||||||
| IntEnz | IntEnz view | |||||
| BRENDA | BRENDA entry | |||||
| ExPASy | NiceZyme view | |||||
| KEGG | KEGG entry | |||||
| MetaCyc | 代謝経路 | |||||
| PRIAM | プロファイル | |||||
| PDB structures | RCSB PDB PDBBe PDBsum | |||||
| Gene Ontology | AmiGO / QuickGO | |||||
| Search | PMC | PubMed | NCBI | |||
MechanismEdit
クエン酸合成酵素はその活性部位（触媒トライアドとして知られている）に3つの重要なアミノ酸を持ち、アセチル-1,2,3を変換する触媒として働いている。CoAとオキサロ酢酸は、アルドール縮合反応によってクエン酸とH-SCoAに変換される。 この反応は、まずAsp-375の負電荷を持つカルボン酸側鎖酸素原子がアセチルCoAのα炭素原子を脱プロトン化してエノラートアニオンを形成し、これがHis-274のプロトン化により中和されてエノール中間体が形成されることから始まる。 この時点で、最後のステップで形成されたHis-274上のε窒素単独電子がヒドロキシルエノールプロトンを抽出してエノール酸アニオンを形成し、オキサロ酢酸のカルボニル炭素への求核攻撃が始まり、次にHis-320のε窒素原子が脱プロトン化される。 この求核攻撃により、シトロイル-CoAが生成される。 このとき、水分子はHis-320のε-窒素原子によって脱プロトン化され、加水分解が開始される。 このとき、酸素の単独対の1つがシトロイル-CoAのカルボニル炭素に求核的にアタックする。 これは四面体の中間体を形成し、カルボニルの改質として-SCoAが放出される結果となる。 この-SCoAがプロトン化されてHSCoAとなる。 最後に、前のステップでカルボニルに付加されたヒドロキシルが脱プロトン化され、クエン酸が生成されます。
クエン酸シンターゼの機構（関与する残基を含む）
阻害編集
ATP：ADPおよびNADH：NAD比が高いとき酵素は阻害されるが、これは細胞にとってATPとNADHが高い濃度のときエネルギー供給力が高いことを示すからである。 また、アセチル-CoAに似たスクシニル-CoAやプロピオニル-CoAによっても阻害され、アセチル-CoAに対しては競合的阻害剤、オキサロ酢酸に対しては非競合的阻害剤として機能する。 クエン酸は反応を阻害し、生成物阻害の一例である。アセチル-CoA類似体によるクエン酸合成酵素の阻害もよく知られており、単一の活性部位の存在を証明するために用いられてきた。 これらの実験から、この単一部位は2つの形態を交互に持ち、それぞれリガーゼとヒドロラーゼ活性に関与することが明らかになった。 このタンパク質は、アロステリック制御のモルフェインモデルを利用している可能性がある
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