25歳で競技ドライバーを引退したホーナーは、1999年のFIA F3000でヴィクトル・マスロフとマルク・グーセンスと契約した。 この年の初め、デイブ・リチャーズのプロドライブ組織は、ロシアの石油会社ルコイルの代理としてアーデンの50％の株式を購入。 ホーナーは1シーズンの後、プロドライブのアーデン株を買い戻した。
ルコイルと決別した後、2002年には新しいドライバーラインアップが採用され、マニングとマスロフの代わりにトマーシュ・エンゲとビヨルン・ビルドハイムが加入した。 チームは5勝（エンゲ4勝、ビルドハイム1勝）を挙げ、エンゲはこの年のタイトルを獲得したが、薬物検査に引っかかり3位に降格、タイトルはセバスチャン・ボーデに渡ってしまった。 チーム選手権はアーデンが獲得した。
2003年はビルドハイムが残留し、エンジェはタウンゼント・ベルに交代。 ビヨン・ビルドハイムは、2位のリカルド・スペラフィコに35ポイントの差をつけてタイトルを獲得した。 459>
F3000の最終シーズンとなった2004年は、アーデンのリードドライバーであるビタントニオ・リウッツィが主役となり、ロバート・ドーンボスのサポートにより、大差でドライバーズとコンストラクターズの両チャンピオンを獲得。 この年、チームは全10戦中8戦で優勝、リウッツィが7戦、ドーンボスが1戦で優勝している。 リウッツィはマネージャーのヘルムート・マルコが、レッドブルのスポンサーシップを得てチームに招いた。 この頃、ホーナーはバンベリーのプロドライブにあるアーデン・インターナショナル・チームを拠点とし、その後近くにある旧22モータースポーツ施設に移設した。 エディ・ジョーダンとジョーダン・グランプリの買収について話し合ったが、コスト面での意見の相違から実現せず、2004年11月にオーストリアのエナジードリンク会社であるレッドブルがジャガーF1チームを買収し、レッドブル・レーシングとなった。 2005年1月、当時最年少のチーム代表となったホーナーがチームのトップに就任。 開幕戦オーストラリアGPのわずか8週間前に任命されたにもかかわらず、彼の指揮下でチームは好スタートを切り、ドライバーのデビッド・クルサードとクリスチャン・クリエンはオーストラリアで4位と7位に入り、前年のジャガーの獲得ポイント9に対して、チーム合計34ポイントを獲得している。 2006年は過渡期の年であり、ニューイがレッドブルで仕事を始めた2006年2月にはすでにその年のマシン（RB2）が設計されており、エンジンはコスワースからフェラーリのカスタマーエンジンに変更されたが、過熱して信頼性に欠けるものだった。 しかし、モナコGPでチーム初の表彰台を獲得し、ホーナーはスーパーマンのマントだけでプールに飛び込んで祝った。
2007年にはチーム初のニューイ設計によるRB3が登場し、マーク・ウェバーとルノーエンジンが加わったが、チームは引き続き信頼性に問題を抱え、14回のリタイアと1回の表彰台獲得に終わり、翌年はコンストラクターズ選手権で7位に転落している。。