クロモプラストは広く研究されておらず、科学研究の中心的な存在になることはほとんどない。 トマト植物（Solanum lycopersicum）の研究では、しばしばその役割を担っています。 リコピンは栽培トマトの熟した果実の赤色の原因であり、花の黄色はキサントフィル類のビオキサンチンとネオキサンチンによるものです。
カロテノイド生合成はクロモプラストと葉緑体の両方で行われます。 トマトの花の色素体では、カロテノイドの合成はPsyl、Pds、Lcy-b、Cyc-bという遺伝子によって制御されている。 これらの遺伝子は、その他にも、器官や構造物におけるカロテノイドの形成に関与している。 例えば、Lcy-e遺伝子は葉で高発現し、カロテノイドのルテインを生成する。
白い花は、トマトの植物では劣性対立遺伝子によって引き起こされる。 受粉率が低くなるため、栽培作物ではあまり好まれない。 ある研究では、白い花にもクロモプラストが残っていることが判明しました。 その花びらや葯に黄色い色素がないのは、カロテノイド生合成経路を破壊するCrtR-b2遺伝子の変異によるものです。
クロモプラストの形成過程全体は、まだ分子レベルで完全に解明されているわけではありません。 しかし、電子顕微鏡により、葉緑体から色葉体への変化の一端が明らかになった。 その変容は、粒間チラコイドとグラナの溶解による内膜システムの改造から始まる。 新しい膜システムは、チラコイド叢と呼ばれる組織化された膜複合体として形成される。 新しい膜はカロテノイド結晶の形成の場となる。 この新しく合成された膜は、チラコイドからではなく、プラスティドの内膜から生成される小胞からもたらされる。 最もわかりやすい生化学的変化は、光合成遺伝子の発現がダウンレギュレートされ、クロロフィルが失われて光合成活動が停止することだろう。
オレンジでは、カロテノイドの合成とクロロフィルの消失により、果実の色が緑から黄色に変化する。 3581>
バレンシアオレンジ Citris sinensis Lは、フロリダ州で広く栽培されているオレンジです。 バレンシアオレンジは、冬になるとオレンジ色の果皮になり、春から夏にかけては緑色の果皮になります。 当初、クロモプラストはプラスチッドの最終段階と考えられていたが、1966年にクロモプラストがクロロプラストに戻ることが証明され、オレンジが緑色に戻るようになった
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