トランスレーショナルリサーチで血液サンプルの利用を始めようとお考えですか？ 転移性乳がんや非小細胞肺がんにご興味があるかもしれません。 あるいは、固形腫瘍サンプルの課題や限界から、そろそろ……とお考えでしょうか。 無細胞DNA（またはcfDNA）とは、血流中のカプセル化されていないすべてのDNAのことを指します。 cfDNAは、アポトーシスやネクローシスの過程で血流に入り込んだ核酸断片である。 通常、これらの断片はマクロファージによって掃除されますが、がんでは細胞が過剰に増殖するため、cfDNAがより多く残ると考えています。 これらの断片は平均して約170塩基の長さで、半減期は約2時間、非小細胞肺や乳房など多くの一般的な腫瘍では、初期病期と末期病期の両方に存在する。 とはいえ、cfDNAの濃度は大きく異なり、血漿1ミリリットルあたり1～10万個の断片が発生します。
次世代シーケンサーの世界にしばらく身を置いていると、感度と特異度について知りたくなることがあるかもしれません。 私たちは、20ナノグラムの入力DNAで1パーセント以上の、5ナノグラムで5パーセント以上の頻度の変異体に対して、高い感度と特異性を実証しました。 その方法については、cfDNAアッセイに関するビデオをご覧ください。 検出限界0.1%の分析にcfDNAを使用することについて聞いたことがあるかもしれません。 10 mL の血液サンプルから、Applied Biosystems MagMAX Cell-Free DNA Isolation Kit を使用して、日常的に約 20 ナノグラムの cfDNA、つまり分析に使用できる約 6 分子を取得することができます。 簡単な計算では、検出限界1%の場合、約25分子が期待されます。 0.1%では、2-3分子しか存在しないと予想される。 つまり、0.1%以下では、分析に使える分子が存在しない可能性があるのだ。 また、cfDNAの濃度は非常に変化しやすいことも忘れてはならない。 現在多くの研究者が注目している早期再発や耐性獲得などの重要な段階では、非常に低くなる可能性がある。 血漿から20ナノグラムのDNAをうまく分離するためには、スループットの必要性に応じて、手動と自動の両方の方法があります。 再発モニタリングの研究には、digital PCRを選ぶかもしれない。 治療法の選択に関する研究では、次世代シーケンスアッセイが好まれるかもしれません。 リキッドバイオプシーの研究がどのようなものであっても、当社は、わずかなターゲットから複数の遺伝子アッセイまで、cfDNA解析のための完全なソリューションを提供し、その実現をお手伝いします。 しかし、きっと質問もあることでしょう。 このようなビデオをもっと見るには、チャンネルを購読してください。 そして、迷ったらSeq It Out！
を思い出してください。