Abstract
1992年に我々はカルボキシ末端（C末端）からタンパク質の配列を決定する新しい方法を報告した（Boyd et al.1992）。 この2年間は、C末端のカルボキシル基の初期活性化のメカニズムや、配列決定試薬を用いてアミノ酸の反応性側鎖を意図的に修飾することなどについて研究を続けてきた。 シーケンシングプロトコルに使用する試薬と反応条件の選択により、アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、スレオニンが誘導体化される。 アスパラギン酸とグルタミン酸のアミド化、セリンとスレオニンのアセチル化により、これらの残基のシークエンスにおける収率が向上しています。 現在、アスパラギン酸とグルタミン酸は、表1に見られるように、配列決定が容易なアミノ酸残基として分類されている。 ある残基が確実に呼ばれるかどうかの判断基準は、タンパク質サンプルの1ナノモル中にその残基が存在するときに、その残基をシーケンスして検出できるかどうかである。 平均して、ポリフッ化ビニリデン（PVDF）膜に適用した1ナノモルのタンパク質で、アミノ酸配列が表1の「確実にコールできる」列に記載されている残基を含んでいれば、5サイクルの配列決定が可能である。 1994年のMPSA会議での我々の焦点は、PVDFに固定化されたタンパク質の配列決定において、このC末端配列決定法の現在の有用性を説明することである
。