脳がどのように計算するのかの概要が提案された。 大脳皮質では、第1層の皮質入力（文脈を表す）から第2/3層の錐体細胞へのシナプスで長期増強され、視床皮質（CT）単位で連結されて記憶が保存される。 記憶される信号は、視床や他の皮質領域からの第3層の入力である。 信号はガンマ周波数で記憶される（そして後に呼び出される）。 意識的な思考は、異なる皮質領域のCTユニットの第5層細胞の出力が、視床と皮質の振動入力の寄与によって同期して発火することで構成される。 この皮質出力は皮質下領域に影響を与え、運動を引き起こしたり、運動に参加させたりする。 大脳皮質の出力は小脳に保存され、後に大脳基底核と小脳によって特定の文脈で生成されることがある。 このように、脳は大脳皮質による「意識的」な出力と、大脳基底核と小脳による「自動的」な出力のいずれかを生成することができる。 大脳基底核で文脈が認識されると、小脳に蓄積された出力が開始され、大脳基底核は複雑な出力や運動のシーケンスを制御できるようになる。 ワーキングメモリは、前頭前野が大脳基底核と小脳を同様に使っている。 海馬は、意識的な思考において、異なる皮質領域のすべてのCTループに独自の第1層文脈を提供することにより、皮質出力の記憶と想起に関与している。 さらに思考を想起すると、新たな第1層の文脈がCTループに関連付けられ、海馬の入力がなくても想起できるようになる可能性がある
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