CAZy

この記事は、データベースに関するものです。 アメリカのコミュニティについては、Cazy, West Virginiaを参照。

CAZy は Carbohydrate-Active enZYmes (CAZymes) のデータベースである。 二糖、オリゴ糖、多糖、複合糖質などの複合糖質の合成、代謝、認識に関与する酵素の分類と関連情報が掲載されている。 このデータベースには、グリコシド加水分解酵素、グリコシルトランスフェラーゼ、多糖リアーゼ、糖質エステラーゼ、および非触媒糖質結合モジュールのファミリーが含まれる。 CAZyデータベースには、リグノセルロースの分解に関与するAuxiliary Activityレドックス酵素の分類も含まれている。

CAZy

Database.png

内容

説明

糖鎖活性酵素データベース

問い合わせ先

研究センター

AFMB.L.P.

AFMB.L.P, フランス国立科学研究センター

研究室

グリコゲノミクスグループ

一次引用

ロンバード & al. (2014)

アクセス

ウェブサイト

http://www.cazy.org/

ツール

ウェブ

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZyとはタンパク質配列に基づいて分類したCAZymeにオンラインで常にアクセスするために1999年に設立したサイトです。 1990年代初頭にグリコシド加水分解酵素の分類のために開発されたものである。 新しい項目は、毎日公開されるGenBankに掲載された後、すぐに追加されます。 ハイスループットDNAシーケンスの急速な進化により、CAZyデータベースは爆発的に増え続け、現在では数十万件の配列をカバーしています。 CAZyデータベースは、フランス国立科学研究センターおよびエクスマルセイユ大学付属の研究センターであるAFMBのGlycogenomicsグループによって、引き続きキュレーションおよび開発が行われています。

コメントする