The Journal of Biomedical Informaticsは、生物医学情報学の方法論の分野における高品質のオリジナル研究論文、レビュー、解説への取り組みを反映させています。 生物医学科学（例えば、臨床医学、ヘルスケア、集団健康、トランスレーショナル・バイオインフォマティクス）におけるアプリケーションを動機とする論文を掲載しますが、本誌は、一般的に適用可能で、生物医学情報学の発展科学の基礎を形成する新しい方法論と技法の報告を重視します。 医療機器に関する論文、導入されたシステムの評価（情報技術の臨床試験を含む）、あるいは生物学的プロセス、特定の疾患、治療法に関する洞察を提供する論文は、一般的に他の媒体での発表に適しています。 信号処理や画像解析の応用に関する論文は，生物医学工学の専門誌や他の情報学専門誌の方が適している場合が多いですが，生体信号や画像の保存や利用において生じる情報管理や知識表現・モデリングの問題を重視した論文を掲載することもあります． システムに関する記述は、報告の主な焦点である基礎的な方法論を説明し実証し、その方法論の一般化可能性および/または適用範囲に対処する努力がなされていれば歓迎されます。 また、JBIの国際性を考慮し、英語以外の特定の言語、または国特有の医療システムやアプローチを扱った論文は、国、言語、文化、医療システムにかかわらず、JBIの幅広い読者に関連する一般化できる教訓を提供する場合に限り、JBIに受け入れられることに留意してください
JBIに適した論文とは何ですか？
新しい手法で分析するのに便利なデータセットではなく、医学のニーズに応える論文で、代わりにエンジニアリングジャーナルに掲載されるかもしれません。
研究の動機や結果の評価には、通常医療従事者の関与が必要です。
JBIでは、原著論文の著者に対して以下のように研究内容を説明するよう奨励しています。 そこで私は新しい方法論を開発し、その適切さを評価し、私の実世界のドメインにおける技術の現状と比較しました。 その結果、この新しい手法が他にどのような問題の解決に役立つかを考えるようになりました。 私は議論においてこれに関連し、狭い応用領域に特化しない新しい汎用的な方法論を持っていることを実証しました」
「既存のML-方法を使用しましたが、私は方法の選択に影響を与えるユニークな特性を共有する生物医学問題の空間に既存の方法を適用する方法を説明する「方法の方法」を作成し検証しています」。”
生物医学情報学とは？
「生物医学情報学は、人間の健康を改善する努力に突き動かされて、科学的探究、問題解決、意思決定のための生物医学データ、情報、知識の効果的使用を研究、追求する学際的分野」
C A Kulikowskiら(C), AMIA Board white paper: Definition of biomedical informatics and specification of core competencies for graduate education in the discipline, Journal of the American Medical Informatics Association, vol.19, no.6, pp.931-938, November 2012
生物医学情報学のどの領域がJBIの範囲外なのか
信号処理、イメージング、医療機器、通信ネットワーク、セキュリティについての論文は通常JBIの範囲外になり、生物情報学や疾病モデリングの論文も範囲外である可能性がある。 バイオインフォマティクスや疾患モデルに関する論文も対象外となる可能性があります。JBIの対象となる論文は、医療分野の知識を深く理解し活用した新しいインフォマティクス手法を紹介し、医療への応用が可能であることが求められます。 例えば、DNA配列の構造を予測する論文（トランスレーショナルではない）、感染症の疫学を理解・活用していない、あるいは実際に応用できない疾患伝播モデル論文などは、対象外となります。
JBIの論文の焦点となる手法は、生物医学情報学分野の数ある構成科学のどれから引用してもよい。 その手法はコンピュータサイエンスの分野に関連することが多いですが、JBI論文の多くは、意思決定科学、統計学、認知科学、心理学、情報科学、組織論、経営学など、他の分野からの革新的な手法を強調します。
JBIに投稿するバイオインフォマティクス論文を検討する場合、この方法論の焦点について意識しておいてください。 日常的なインフォマティクス技術の使用に基づく生物学的発見は、重要な生物学的貢献となるかもしれませんが、JBI には適しません。 また、JBIでは、バイオインフォマティクスの論文は、トランスレーショナル（人間）科学の問題を扱う場合にのみ掲載されることをご承知おきください。 論文を投稿する前に、このトピックを扱ったTranslational Bioinformatics editorialを参照してください。
生物医学的プライバシーまたはセキュリティに関する論文は、ヘルスケアと生物医学の課題によって明らかに動機づけられた、新しく実用的な方法論も提供しなければなりません。 他分野で確立された手法が、生物医学の問題に適用されたというだけでは、JBIでの再掲載を保証するものではありません。 また、すでに発表された手法の小さな改良ではなく、実質的な方法論の新規性が記述されている論文も求めています。 この分野の論文の受け入れ方針については、プライバシーとセキュリティの編集をご覧ください。
論文の種類は一般的に7つあります。 通常の研究論文。 既存の技術を応用するのではなく、革新的な手法の開発を必要とした生物医学的または臨床的に動機づけられたシステムまたはアプローチについて発表し、議論する。 動機となるアプリケーションを議論してもよいが、新しい方法は一般化可能性が明確になるように議論されるべきで、理想的には適用範囲の評価も含まれる。 投稿時に論文タイプ「研究論文」を選択してください。
2. 方法論的レビュー論文。 ある方法論の導入、使用、成功、限界についてまとめたレビュー。 また、将来の研究の方向性を提案したり、ある方法を批評し、その方法が適切な解決策でない可能性のある問題の範囲について論じたりすることも多い。 このようなレビューは、特定の応用領域ではなく、手法やアプローチに焦点を当てるべきであることに注意してください（例：「糖尿病管理におけるコンピュータ」などのレビューでの投稿は避けてください）。 投稿時に論文タイプ「Review article」を選択してください。
3. Commentaries: 一般に研究論文よりも短い論文で、既発表の論文や、生物医学情報学研究の方法論的基礎とその応用において重要な領域であるテーマについて論じる傾向がある。 コメンタリーはしばしば募集されるが、編集者と協議の上、誰でも投稿することができる。 解説の投稿を検討されている方は、事前に簡単な企画書を [email protected] までご提出ください。 コメンタリーの投稿が募集されている場合、または編集者によって承認されている場合は、投稿プロセスで記事タイプ「Discussions」を選択し、カバーレターにコメンタリーとしての原稿であることを明記してください。
4 特別通信：これらは、方法論指向の情報科学研究コミュニティにとって幅広い関心を呼ぶ問題を扱う記事である。 ワークショップや調査研究の結果を報告することもあり、一般的に他の人に役立つ教訓やガイダンスを提供する。 このような論文は、革新的な新しい情報科学の方法論について報告する必要はない。 Special Communicationの投稿を検討されている方は、事前に簡単な提案書を [email protected] までお送りください。 Special Communicationの投稿が編集者によって承認された場合は、投稿時に論文タイプ「Discussion」を選択し、カバーレターでSpecial Communicationであることを明記してください。 編集者へのレター 編集者への手紙：編集者への手紙は投稿可能であり、ジャーナルへの掲載が検討される。 通常、既刊の論文にコメントするものです。 投稿時に論文の種類を「Correspondence（通信）」に設定してください。
6. 書評。 編集者は、JBIの読者が興味を持ちそうな新刊書を特定することがある。 そのような本の書評を書くために個人を招待することになるが、そのような投稿は招待者のみである。 未承諾の書評は考慮されません。 投稿時に記事の種類を「書評」と選択してください。
7. 論説 編集者またはその招待者は、時折、社説を掲載するが、未承諾の社説は考慮されない。 投稿時に論文タイプ「Editorial」を選択してください。
特集号の論文募集に応じて投稿する場合、投稿カテゴリーは特集号のタイトルとしますが、カバーレターには論文が方法論レビュー、一般論文、解説のいずれかを明記する必要があります。
論文投稿前に確認する背景
1968年にAcademic PressからComputers and Biomedical Research（CBR）というタイトルで創刊されたJournal of Biomedical Informatics（JBI）は、2001年の34巻からデザインが変わり名称も変更されました。 1968年にCBRが創刊されて以来33年にわたる力強い歴史を踏まえ、私たちはこの分野の進化に照らしてジャーナルを更新し方向転換するために多くの変更を行い、同時に、生物医学情報学の研究論文を掲載する他のジャーナルでは中心的な焦点として明確に認識されていないニッチを埋めることを追求しました。 私たちはその目標を、創刊時の論説で次のように述べました：
「多様な読者に広くアピールするような論文を掲載することはますます難しくなっている。 そこで、今後数年間は、このジャーナルに、よりタイトな焦点を導入することが重要であると判断し、このことを念頭に置いて、より現代的で狭い焦点を反映したジャーナルに改名しました。 Journal of Biomedical Informatics（JBI）は，生物医学情報学の他の主要な学術誌と競争するのではなく，むしろそれを補完することを目的としています。 特に、生物医学の領域を超えて一般化する方法論を解明し、この分野の科学的基盤の形成に貢献する論文を重視したいと考えています。 また、医療機器よりも情報技術、システムの説明や総括的な評価よりも基本的な方法論に関わる論文が多くなる傾向があります。 このジャーナルは、生物医学科学や臨床の問題に対する計算ソリューションの開発で生じる難しい問題に取り組む方法についての新しいアイデアの優れた情報源となることを期待すべきです」
JBI のタイトルで約20年間出版されており、このジャーナルの成功に満足しています。 このジャーナルは卓越性と厳密さで定評があり、読者や出版された著者も同様に、私たちがこのページに引き寄せた仕事と文章の両方の質に感銘を受けていることを望んでいます。
JBIは、方法論や技術における革新を説明したり、興味深いインフォマティクス・プロジェクトの文脈で学んだ、実質的に一般化できる教訓を論じたりして、この分野に概念的に貢献する論文を掲載することを目指しています。 貢献が理論的な根拠を持つ場合、その理論もまた、説明のための適切な強調材料となります。 私たちの経験では、応用から始まった多くの研究プロジェクトは、適切に説明されれば、私たちの学問分野の科学的基盤に貢献する方法論の革新につながるものです。 したがって、興味深い応用例を論じた論文の投稿を控えるのではなく、むしろ、応用例から派生し、他の研究者が恩恵を受けることのできる、一般化可能な方法論的洞察をどのように書き、共有するかという視点を奨励する。 私たちは、そのような論文が科学としての生物医学情報学の中核をなすと信じています
論文が審査なしで返送される主な理由は5つあります。 おそらく最も多いのは、論文が主にインフォマティクスのアプリケーションやその評価に関する記述である場合です。 重要な臨床問題に対処する新しい臨床システムであっても、新しい方法論を提供していないのであれば、応用情報学や臨床応用分野の別の雑誌の方が適切でしょう。 同様に、アンケート調査やユーザーニーズの分析も、そのような調査や分析を行うための新しい手法や、ユーザー行動、認知科学、人間とコンピュータの相互作用に関する新しい洞察に貢献する場合にのみ、JBIにふさわしいと思われます。 特に、情報処理や管理、知識ベースのアプローチではなく、数値的手法や生理学的モニタリングに重点が置かれている場合によく起こります。 このような論文は、一般に、生物医学工学の専門誌か、応用領域の臨床専門誌（例． 8239>
第三に、バイオメディカル・インフォマティクスの分野は、人間の健康や病気の治療に良い影響を与えることがすべてのアプリケーションの動機となっているため、JBIに投稿するバイオインフォマティクス論文はトランスレーショナル・バイオインフォマティクス（TBI）の分野であるべきです。） 私たちは、広く応用できる基本的なバイオインフォマティクスの解決策（例えば、マイクロアレイの分析方法）を扱っていても、人間の健康や病気を特に動機としていない論文は、審査なしで日常的に拒絶しています。 従って、農学や動物学に特化した植物や動物のバイオインフォマティクスやゲノミクスの手法を扱った論文は掲載しないことにしています。
第四に、私たちはJBIに投稿されたすべての論文を、支援ソフトウェアを用いて評価し、他の出版物からテキストを大幅に再利用している証拠があるかどうかを調べています。 場合によっては、新しい論文に先行文献が引用されていないこともあります。 原稿の著者が再利用された論文の著者であるかどうかにかかわらず、他の出版物との重複が著しい論文の審査は、通常お断りしています。 このような行為は、剽窃（または自己剽窃）の懸念があるだけでなく、新しい原稿で発表される研究の新規性にも疑問を投げかけることになります。 私たちは、すべての論文が新規に書かれたものであることを期待し、原稿（およびカバーレター）には、その新しい研究が、過去に発表された研究に基づいてどのように構築され、どのように強化され、どのようにその能力を超えたかを明らかにするよう求めています。
最後に、JBIは国際的なジャーナルであり、英語が母国語でない著者が直面する課題を理解していますが、英語の表現に深刻な問題があるため、その論文を科学的審査プロセスにかけるには、英語に詳しい編集者や共著者の関与を示唆し、拒絶するか修正を求める論文を返送する場合があります。 言語に関する軽微な問題は編集の過程で修正できますが、より深刻な問題は科学的貢献の適切な評価の妨げになります。
審査に回った論文のうち、最終的なアクセプト率は現在約25％です。 出版されたすべての論文は大幅な修正を経てから受理されているので、論文が出版できる状態になる前に修正が必要になったとしても、著者は驚くべきではないでしょう。 しかし、私たちは、査読と修正のプロセスに厳格さを導入することで、より優れた、より科学的に有用な成果物を生み出すことができたと考えています。 たとえば、引用やダウンロードのデータと同様に、ほぼ毎号に掲載されている方法論レビューが、教育や研究の目的で広く利用されていることを示す逸話的なフィードバックがあります
CBRからJBIへの移行後、投稿論文の数は年々増加しています。 初年度は約100本の原稿をいただきましたが、今では年間800本を優に超える論文をいただいています。 その結果、ジャーナルの規模も大きくなり、1号あたりの論文数も多くなっています。 また、年に2、3号は、ゲスト・エディターが監修する特別な方法論のトピックに充てられており、そのような特集号が提案されます。 採用された論文は直ちにオンラインで公開され、Medlineに索引付けされます。 論文はその後すぐに、ScienceDirectで編集された「仮想」号に掲載されます。 2016年以降、JBIジャーナルへのアクセスの大部分はインターネットとScienceDirectを通じてであることを知り、私たちは印刷版の作成を中止しました。 フルイシューのハードコピーは、エルゼビアからプリント・オン・デマンド・サービスで入手できます。 論文は、著者が料金を支払うことでオープンアクセスで出版することができますが、それ以外の場合は、出版後12ヶ月間は購読者のみが利用できます。 その後、ScienceDirectのオープンアーカイブでフリーアクセスに開放されます。 また、オンライン専用誌のため、投稿原稿の図や写真のカラー使用には制限がなく、料金も無料です。
あなたの最高の方法論的作品をJBIに投稿することをお勧めします。 私たちは、編集者だけでなく査読者の判断により、革新的なアプローチを深く議論する機会を提供し、個々の論文の長さに関する単語数やその他の指標に関する恣意的な制限を避けていることを心に留めておいてください。 また、博士論文の論文を奨励し、論文で行われる広範なトピックレビューが、しばしばJBIに適した方法論レビュー論文を作成するために適応されることを強調しています。
Biomedical Informaticsは急成長中の分野で、生物医学と臨床の世界全体に重要な応用と影響を及ぼしています。 私たちは、研究コミュニティがJBIを、この分野の科学的基盤を最もよく定義する雑誌として常に認識することを切望しています。
Mor Peleg
Editor-in-Chief
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