1999年から2年間の予定で再開発が行われたBABYLON。 費用は1000万マルクで、主にドイツ政府から資金援助がありました。 座席と技術設備には、宝くじの開発資金200万ユーロがあてられました。 大講堂の屋根と天井は改修された。 天井の木製の根太は重量に耐えられなくなったため、鉄骨の桁に置き換えられ、その上に新しい屋根が架けられた。 7520>
修復の目的は、ある時点の姿に戻すのではなく、この建物の歴史の中で使われてきたさまざまな要素を残すことでした。 ホワイエは1928年の開館当時の姿に戻し、講堂は豪華な座席と漆喰や金メッキのディテールで1948年当時のスタイルに改修されました。 この建物はもともと映画館と劇場として使われていたため、スクリーンの後ろにバックステージエリアがありました。 そこで、修復の一環として新しい小講堂が建てられたのです。 大講堂のオーケストラピットも修復され、無声映画の上映中に室内楽団が生演奏できるようになりました。 1999年には、70年の歴史を持つJ.D.フィリップス社のシネマオルガンが修復されました。
2001年5月には、オーソン・ウェルズ監督の映画「オセロ」が上映され、観客席はリニューアルオープンした。 2002年、「ベルリン・フィルムアート・バビロン」協会は、ドイツ記念碑保護財団から「銀の半球」を授与されました。 建築家ヨアヒム・ローマーとクラウス・マイヤー＝ロッゲは、「映画建築の重要な建物」を保存したことで表彰されました。
バビロンは、ベルリン国際映画祭（ベルリナーレ）の会場になりました。 2001年5月26日、「ゴーレム：彼はいかにしてこの世に生を受けたか」の上映で、修復された映画用オルガンが再出発しました。 7520>
2009年、アナルコ・シンディカリストの自由労働組合（FAU）のメンバーである一部の従業員が、賃金の引き上げと労働条件の改善を求めました。 2009年7月末、FAUのベルリン支部は映画館をボイコットするよう呼びかけた。 Ver.di労働組合は、2010年1月1日から従業員と労働協約を締結した。 2009年、映画館の運営会社はFAUと、労働組合として指定される権利に関して法的紛争を起こした。 2009年10月、ベルリン・ブランデンブルク雇用裁判所は、FAUには賃金交渉を行う権利があると決定した。 2009 年 12 月にベルリン高等裁判所が出した仮処分命令は、FAUベルリンが追って通知される まで労働組合を名乗ることを禁じた。 これは2010年6月に最高裁判所によって覆された
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