| Citrat (Si)-sintetază | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Identificatori | ||||||
| EC nr. | 2.3.3.1 | |||||
| CAS nr. | 9027-96-7 | |||||
| Baze de date | ||||||
| IntEnz | IntEnz view | |||||
| BRENDA | BRENDA intrare | |||||
| ExPASy | NiceZyme vizualizare | |||||
| KEGG | KEGG entry | |||||
| MetaCyc | metabolic pathway | |||||
| PRIAM | profile | |||||
| PDB structures | RCSB PDB PDB PDBe PDBsum | |||||
| Gene Ontology | AmiGO / QuickGO | |||||
| Search | PMC | PubMed | NCBI | |||
MecanismEdit
Citratul sintetază are trei aminoacizi cheie în situsul său activ (cunoscut sub numele de triada catalitică) care catalizează conversia acetil-CoA și oxaloacetat în citrat și H-SCoA într-o reacție de condensare aldolică. Această conversie începe cu atomul de oxigen al lanțului lateral carboxilat încărcat negativ al lui Asp-375 care deprotonează atomul de carbon alfa al acetil-CoA pentru a forma un anion enolat care, la rândul său, este neutralizat prin protonare de His-274 pentru a forma un enol intermediar . În acest moment, perechea de electroni singuratici ai azotului epsilon de pe His-274, formată în ultima etapă, extrage protonul hidroxil enol pentru a forma un anion enolat care inițiază un atac nucleofilic asupra carbonului carbonil al oxaloacetatului care, la rândul său, deprotonează atomul de azot epsilon al lui His-320. Această adiție nucleofilă duce la formarea citroil-CoA . În acest moment, o moleculă de apă este deprotonată de atomul de azot epsilon al His-320 și se inițiază hidroliza. Una dintre perechile singuratice ale oxigenului atacă nucleofilic carbonul carbonil al citroil-CoA. Aceasta formează un intermediar tetraedric și are ca rezultat ejectarea de -SCoA pe măsură ce carbonilul se reformează. -SCoA este protonat pentru a forma HSCoA. În cele din urmă, hidroxilul adăugat la carbonil în etapa anterioară este deprotonat și se formează citratul.
InhibițieEdit
Enzima este inhibată de rapoarte mari de ATP:ADP și NADH:NAD, deoarece concentrațiile mari de ATP și NADH arată că aportul de energie este mare pentru celulă. De asemenea, este inhibată de succinil-CoA și propionil-CoA, care seamănă cu acetil-CoA și acționează ca un inhibitor competitiv pentru acetil-CoA și un inhibitor necompetitiv pentru oxaloacetat. Citratul inhibă reacția și este un exemplu de inhibiție a produsului.Inhibarea citrat-sintetazei de către analogii acetil-CoA a fost, de asemenea, bine documentată și a fost utilizată pentru a dovedi existența unui singur situs activ. Aceste experimente au arătat că acest situs unic alternează între două forme, care participă la activitatea de ligază și, respectiv, de hidrolază. Este posibil ca această proteină să utilizeze modelul morfeinei de reglare alosterică.
.