În mod tradițional, compușii de clatrat se referă la gazde polimerice care conțin oaspeți moleculari. Mai recent, termenul se referă la multe gazde moleculare, inclusiv calixarene și ciclodextrine și chiar la unii polimeri anorganici, cum ar fi zeoliții. Mineralul natural de clatrat de siliciu, chibaitul, a fost descris din Japonia în 2008.
Mulți clatrați sunt derivați din cadre organice cu legături de hidrogen. Aceste cadre sunt preparate din molecule care se „autoasociază” prin interacțiuni multiple de legături de hidrogen. Cei mai cunoscuți clathrați sunt clathrații de metan în care cadrul cu legături de hidrogen este contribuit de apă, iar moleculele invitate sunt metanul. Cantități mari de metan înghețat în mod natural sub această formă există atât în formațiunile de permafrost, cât și sub fundul mărilor oceanice. Alte rețele cu legături de hidrogen sunt derivate din hidrochinonă, uree și tiouree. O moleculă gazdă foarte studiată este compusul lui Dianin.
Compușii Hofmann sunt polimeri de coordinare cu formula Ni(CN)4-Ni(NH3)2. Aceste materiale cristalizează cu oaspeți aromatici mici (benzen, anumite xilene), iar această selectivitate a fost exploatată comercial pentru separarea acestor hidrocarburi. Cadrele organo-metalice (MOF) formează clatrați.
Compușii cu colivie sensibilă la fotolitic au fost examinați ca recipiente pentru eliberarea unui medicament sau a unui reactiv.
.