Cromoplastul nu este studiat pe scară largă și este rareori obiectul principal al cercetării științifice. Ele joacă adesea un rol în cercetarea asupra plantei de tomate (Solanum lycopersicum). Licopenul este responsabil pentru culoarea roșie a unui fruct copt la roșia cultivată, în timp ce culoarea galbenă a florilor se datorează xantofilelor violaxantină și neoxantină.
Biosinteza carotenoidelor are loc atât în cromoplaste, cât și în cloroplaste. În cromoplastele florilor de tomate, sinteza carotenoidelor este reglată de genele Psyl, Pds, Lcy-b și Cyc-b. Aceste gene, pe lângă altele, sunt responsabile pentru formarea de carotenoizi în organe și structuri. De exemplu, gena Lcy-e este puternic exprimată în frunze, ceea ce duce la producerea carotenoidului luteină.
Floarea albă este cauzată de o alelă recesivă la plantele de tomate. Ele sunt mai puțin dorite în culturile cultivate deoarece au o rată de polenizare mai mică. Într-un studiu, s-a constatat că cromoplastele sunt încă prezente în florile albe. Lipsa pigmentului galben din petalele și anterele acestora se datorează unei mutații în gena CrtR-b2 care întrerupe calea de biosinteză a carotenoidelor.
Întregul proces de formare a cromoplastelor nu este încă complet înțeles la nivel molecular. Cu toate acestea, microscopia electronică a dezvăluit o parte din transformarea din cloroplast în cromoplast. Transformarea începe cu remodelarea sistemului membranar intern, cu liza tilacoidelor intergranulare și a granei. Noile sisteme membranare se formează în complexe membranare organizate, numite plexuri tilacoide. Noile membrane sunt locul de formare a cristalelor de carotenoizi. Aceste membrane nou sintetizate nu provin din thylakoizi, ci mai degrabă din vezicule generate din membrana internă a plastidei. Cea mai evidentă modificare biochimică ar fi reglarea în jos a expresiei genelor fotosintetice, ceea ce duce la pierderea clorofilei și stoparea activității fotosintetice.
La portocale, sinteza carotenoizilor și dispariția clorofilei determină schimbarea culorii fructului din verde în galben. Culoarea portocalie este adesea adăugată în mod artificial – galben-portocaliu deschis este culoarea naturală creată de cromoplastele reale.
Naranja Valencia Citris sinensis L este o portocală cultivată pe scară largă în statul Florida. În timpul iernii, portocalele Valencia ating culoarea optimă portocalie a coajei, revenind la o culoare verde primăvara și vara. Deși inițial s-a crezut că cromoplastele reprezintă stadiul final al dezvoltării plastidiilor, în 1966 s-a dovedit că cromoplastele pot reveni la cloroplaste, ceea ce face ca portocalele să revină la culoarea verde.
.