Începem cu o introducere în biologia relevantă, explicând ce măsurăm și de ce. Apoi ne concentrăm pe cele două tehnologii principale de măsurare: secvențierea de generație următoare și microplăcile. Trecem apoi la descrierea modului în care datele brute și informațiile experimentale sunt importate în R și a modului în care folosim clasele Bioconductor pentru a organiza aceste date, fie că sunt generate local, fie că sunt culese din depozite publice sau arhive instituționale. Caracteristicile genomice sunt în general identificate folosind intervale în coordonate genomice, iar algoritmii foarte eficienți pentru calculul cu intervale genomice vor fi examinați în detaliu. Metodele statistice pentru testarea ipotezelor centrate pe gene sau pe căi cu date la scară genomică se găsesc în pachete precum limma, unele dintre aceste tehnici vor fi ilustrate în prelegeri și laboratoare.
Datorită diversității de pregătire a studenților noștri, am împărțit seria în șapte părți. Puteți urma întreaga serie sau cursuri individuale care vă interesează. Dacă sunteți statisticieni, ar trebui să luați în considerare posibilitatea de a sări peste primele două sau trei cursuri, în mod similar, dacă sunteți biologi, ar trebui să luați în considerare posibilitatea de a sări peste unele dintre cursurile introductive de biologie. Rețineți că aspectele de statistică și programare ale clasei cresc în dificultate relativ repede în primele trei cursuri. Până la al treilea curs se vor preda concepte statistice avansate, cum ar fi modelele ierarhice, iar până la al patrulea curs se vor preda abilități avansate de inginerie software, cum ar fi calculul paralel și concepte de cercetare reproductibilă.
Aceste cursuri alcătuiesc două certificate profesionale și se desfășoară în ritm propriu:
Data Analysis for Life Sciences:
- PH525.1x: Statistică și R pentru științele vieții
- PH525.2x: Introducere în modelele liniare și algebră matriceală
- PH525.3x: Inferență statistică și modelare pentru experimente de mare capacitate
- PH525.4x: High-Dimensional Data Analysis
Genomics Data Analysis:
- PH525.5x: Introducere în Bioconductor
- PH525.6x: Studii de caz în genomica funcțională
- PH525.7x: Advanced Bioconductor
Acest curs a fost susținut parțial de grantul NIH R25GM114818.
HarvardX cere persoanelor care se înscriu la cursurile sale pe edX să respecte termenii codului de onoare edX. HarvardX va lua măsuri corective adecvate ca răspuns la încălcările codului de onoare edX, care pot include concedierea de la cursul HarvardX; revocarea oricăror certificate primite pentru cursul HarvardX; sau alte remedii, în funcție de circumstanțe. Nu se vor emite rambursări în cazul unor măsuri corective pentru astfel de încălcări. Persoanele înscrise care urmează cursurile HarvardX ca parte a unui alt program vor fi, de asemenea, guvernate de politicile academice ale acelor programe.
HarvardX urmărește știința învățării. Prin înscrierea ca cursant online la un curs HX, veți participa, de asemenea, la cercetări despre învățare. Citiți declarația noastră de cercetare pentru a afla mai multe.
Universitatea Harvard și HarvardX se angajează să mențină un mediu educațional și de lucru sigur și sănătos, în care niciun membru al comunității nu este exclus de la participare, nu i se refuză beneficiile sau nu este supus discriminării sau hărțuirii în cadrul programului nostru. Toți membrii comunității HarvardX trebuie să respecte politicile Harvard privind nediscriminarea, inclusiv hărțuirea sexuală, și Termenii de utilizare edX. Dacă aveți întrebări sau nelămuriri, vă rugăm să contactați [email protected] și/sau să raportați experiența dvs. prin intermediul formularului de contact edX.