Cardinal Mooney a fost fondat în 1956 și este administrat de Dieceza Romano-Catolică din Youngstown. La începutul anilor 1950, Dieceza de Youngstown a recunoscut necesitatea de a extinde Ursuline High School și de a construi un nou liceu parohial în partea de sud. În 1953, episcopul Emmet M. Walsh a obținut actualul amplasament al Liceului Cardinal Mooney de la Departamentul de Parcuri din Youngstown și a început organizarea unui comitet de strângere de fonduri pentru liceu.
Pământul a fost pus în funcțiune în 1954, iar în toamna anului 1955 a fost organizată prima clasă de boboci, care a început să urmeze cursurile la vechea mănăstire Glenmary. Construcția Cardinal Mooney a fost finalizată la timp pentru prima zi de școală din septembrie 1956. Un total de 610 studenți au fost înscriși ca boboci sau studenți de anul doi. Școala a fost numită după Cardinalul Edward Mooney, un fost sudist, care a fost arhiepiscop de Detroit. Acesta se distinsese ca erudit și diplomat al Vaticanului.
Părintele William Anthony Hughes, mai târziu episcop de Covington, Kentucky, a fost numit primul director al școlii. Roșu și auriu au fost alese ca și culori ale școlii. Acestea simbolizau sângele martirilor și responsabilitatea tuturor creștinilor de a accepta suferința și Sfântul Sacrament.
Facultatea inițială a inclus surori din comunitățile Ursulinelor, Dominicane, Notre Dame și Vincentiene, doi preoți și cinci profesori laici.
În iunie 1959, prima promoție de absolvenți a celebrat slujba de bacalaureat la Catedrala St. Columba, iar pe 7 iunie au avut loc ceremoniile de absolvire la Stambaugh Auditorium.
Înscrierile au crescut rapid la începutul anilor ’60. Până în 1960 se plănuia o adăugire la Cardinal Mooney și un surplus de elevi frecventau din nou cursurile la vechea mănăstire Glenmary. Adăugarea a fost deschisă în 1961. Aceasta includea un auditoriu, șapte săli de clasă și un laborator de fizică.
La începutul anului 2000, Cardinal Mooney a intrat în posesia celor două clădiri militare anexe adiacente la terenul școlii. La scurt timp după obținerea acestor imobile, a început construcția noului complex sportiv al liceului. Finalizat la sfârșitul anului 2001, complexul sportiv Cardinal Mooney oferă o instalație de antrenament atletic bine rotunjită, unde pot fi găzduite competițiile atletice oficiale OHSAA. Complexul include un teren de fotbal regulamentar, două terenuri de antrenament adiacente, două terenuri de tenis, un putting green de antrenament, un teren de fotbal de antrenament, două terenuri de baseball de antrenament, o mică cușcă de baseball, o piscină de antrenament și o pistă cauciucată pe toată lungimea, care înconjoară terenul principal de fotbal. Clădirile anexe ale armatei americane și ale marinei americane au rămas în picioare în timpul construcției, dar Rush Boulevard a fost umplut cu pământ vegetal și izolat de lotul din spate. Clădirile, acum denumite Cardinal Mooney Industrial Arts Center, au fost transformate de atunci în garaje unde clasele de atelier pot lucra la vehicule și unde se pot preda cursuri de conducere în timpul vacanțelor de vară.
2013 relocareaEdit
La 3 septembrie 2013, episcopul Diecezei Romano-Catolice de Youngstown, George Murry, a aprobat relocarea liceului din partea de sud a orașului Youngstown în suburbiile din comitatul Mahoning. Cu toate acestea, aprobarea sa a fost însoțită de stipulații care au inclus dovada unui sprijin financiar suficient atât pentru o nouă clădire a liceului, cât și pentru un fond de dotare care să ofere burse pentru elevii care se confruntă cu sărăcia și alte constrângeri sociale.
Un studiu publicat în aprilie 2013 (realizat de Catholic School Management, Inc. din Madison, Connecticut) a determinat că școala ar susține un număr mai bun de înscrieri și pentru o perioadă mai lungă de timp dacă s-ar muta.
Început, episcopul Murry s-a opus mutării, declarând că un factor important în această decizie a fost faptul că ar fi mai ieftin să se facă renovări decât să se construiască o clădire nouă. În plus, a spus el în declarația sa, este important pentru dieceză să fie buni administratori ai finanțelor lor. Superintendentul diecezan al școlilor catolice a reluat poziția inițială a lui Murry și a recunoscut planurile care pot fi puse în aplicare pentru viitorul școlii în locația sa actuală. Subiectul a fost unul controversat în rândul părinților și al absolvenților de când a început discuția despre mutare, în 2013.
Pentru anul școlar 2015, au început lucrările de renovare a locației actuale, ceea ce face ca mutarea să fie puțin probabilă. Școala se află în locația actuală de pe Erie Street din 1956.
.