Protocoalele alternative împotriva cancerului folosesc terapia enzimatică în doze mari pentru a distruge tumorile, a curăța sistemul circulator de resturi și a stimula funcția imunitară. Enzimele sistemice, utilizate în aceste protocoale, descompun învelișul protector al virusurilor, eliberându-le astfel încât acestea să poată fi identificate și atacate de sistemul imunitar. Virușii și alte microorganisme patogene cresc foarte mult încărcătura toxică, împovărând sistemul imunitar. Eliminarea acestor infecții este primordială pentru o funcționare optimă a sistemului imunitar.
Acest același proces se aplică și în cazul celulelor canceroase. Atunci când fibrina este descompusă, sistemul imunitar este apoi capabil să țintească mai eficient invadatorii patogeni. Enzimele cresc, de asemenea, funcția imunitară prin stimularea moleculelor imunitare, cum ar fi citokinele, macrofagele și celulele ucigașe naturale. Cu sistemul imunitar funcționând la turație maximă, acesta își poate îndeplini sarcinile de prevenire a creșterii și răspândirii cancerului.
Enzimele sistemice sporesc eficiența terapiilor convenționale împotriva cancerului, cum ar fi chimioterapia și radiațiile. Chimioterapia este mai capabilă să atace mai bine celulele canceroase atunci când fibrina este descompusă și pot fi folosite doze mai mici. Datorită efectelor lor antiinflamatorii și analgezice, enzimele sunt utile în atenuarea efectelor secundare negative ale chimioterapiei, cum ar fi vărsăturile, durerea, pierderea mușchilor și epuizarea. Enzimele sunt, de asemenea, utile în descompunerea țesutului cicatricial, un efect secundar al radiațiilor. Mai mult, pacienții se recuperează mai repede după o intervenție chirurgicală atunci când iau enzime.