Trimetoprima-sulfametoxazol (TMP-SMX), sau Bactrim*, Septra* sau Cotrim*, este tratamentul de elecție. Regimul tipic pentru adulții imunocompetenți este TMP 160 mg plus SMX 800 mg (un comprimat de putere dublă), pe cale orală, de două ori pe zi, timp de 7-10 zile. Pacienții infectați cu HIV pot avea nevoie de cure mai lungi de tratament.
Nu au fost identificate încă alternative foarte eficiente pentru persoanele care sunt alergice la (sau sunt intolerante la) TMP-SMX. Abordările care trebuie luate în considerare pentru astfel de persoane includ observarea și tratamentul simptomatic, utilizarea unui antibiotic a cărui eficacitate împotriva Cyclospora se bazează pe date limitate sau desensibilizarea la TMP-SMX. Această din urmă abordare ar trebui să fie luată în considerare numai pentru pacienții selectați care necesită tratament, care au fost evaluați de un alergolog și care nu au o alergie care să le pună viața în pericol.
Datele anecdotice sau nepublicate sugerează că următoarele medicamente sunt ineficiente: albendazol, trimetoprim (atunci când este utilizat ca agent unic), azitromicină, acid nalidixic, tinidazol, metronidazol, chinacrină, tetraciclină, doxiciclină și furoat de diloxanidă. Deși datele unui mic studiu efectuat în Haiti în rândul pacienților infectați cu HIV au sugerat că ciprofloxacina ar putea avea o activitate modestă împotriva Cyclospora, o experiență anecdotică substanțială în rândul multor persoane imunocompetente sugerează că ciprofloxacina este ineficientă.
* Utilizarea denumirilor comerciale este doar pentru identificare și nu implică aprobarea de către Serviciul de Sănătate Publică sau de către Departamentul de Sănătate și Servicii Umane al SUA.
.