Som doktorand är det en vanlig del av min vecka att undervisa i biologilaborationer, och den laboration som jag undervisar i de flesta kvartalen handlar om fylogenetik och biologisk mångfald. På senare tid har jag haft diskussioner om fylogenetiska termer med mina studenter, andra assistenter och den personal och de professorer som ansvarar för klassen. Terminologin blir ofta förvirrande inom fylogenetiken, och ord används ibland för att betyda olika saker av olika personer. Ett av de facetter som gör termerna extra förvirrande är att de inte utesluter varandra utan beror på vilka grupper som diskuteras, så till exempel kan ett drag vara både en synapomorfi och en autapomorfi (se nedan) beroende på vilka grupper som undersöks. Så, i ett försök att reda ut saker och ting i mitt eget huvud, och förhoppningsvis på så sätt kunna lära ut dem mer effektivt, följer här några vanligt förekommande termer inom kladistik med tillhörande definitioner och förklaringar.
Apomprphy – Ett härlett karaktärstillstånd. Detta är allt som är en innovation längs en evolutionär linje. Alltså något som skiljer sig från det förfödda karaktärstillståndet. Inom fylum Chordata skulle till exempel utvecklingen av en kotpelare, som är något som linjer som förgrenat sig tidigare i Chordate-utvecklingen inte har och som därför är nytt i klassen Vertebrata, vara en apomorfi.
Synapomorfi – Ett gemensamt, härlett karaktärstillstånd. Detta är en apomorfi som två taxa delar och som antas ha funnits hos dessa två taxas gemensamma förfader. Ett exempel är fjädrar hos fåglar. Alla fåglar har fjädrar, och det antas att de har fjädrar eftersom den gemensamma förfadern till alla fåglar hade fjädrar och förde den egenskapen vidare genom generationerna.
Plesiomorfi – Ett karaktärstillstånd från förfadern. Detta är varje egenskap som ärvdes från en grupps förfader. Till exempel är reptiler exotermiska, de håller inte en konstant inre kroppstemperatur. De har denna egenskap eftersom förfadern till alla reptiler var exotermisk. Detta skiljer sig från en synapomorfi eftersom vissa ättlingar till de första reptilerna inte är exoterma (fåglar är endoterma). Med andra ord är detta karaktärsdrag förfädernas, men delas av vissa, men inte alla, av dessa förfäder; ättlingar.
Symplesiomorfi – Ett delat, förfädernas karaktärstillstånd. Detta är varje egenskap som ärvdes från en grupps förfader och som har förts vidare till mer än en efterkommande släktlinje. För att fortsätta med exemplet för en plesiomorfi, det faktum att krokodiler och sköldpaddor båda är exotermiska, men
Autapomorfi – En härledd egenskap som är unik för en viss taxa. Dessa är inte användbara för att avgöra hur grupper är besläktade eftersom endast en grupp kommer att ha den särskilda egenskapen. De är dock mycket användbara för att identifiera taxa. Fjädrar förekommer till exempel bara hos fåglar. Detta gör att egenskapen ”fjädrar” är en autapomorfi för klassen Aves. Karaktären ”fjädrar” är också en synapomorfi för taxa inom klassen Aves. Både rovfåglar och sångfåglar har fjädrar och de ärvde dem från en gemensam förfader.
Öppna cirklar = förfäders karaktärstillstånd, fyllda cirklar = härledda karaktärstillstånd.
Läs hela inlägget”