Jako postgraduální student jsem se pravidelně věnoval výuce biologických laboratoří a většinu čtvrtletí jsem učil fylogenetiku a biodiverzitu. V poslední době vedu diskuse o fylogenetických termínech se svými studenty, kolegy TA a zaměstnanci a profesory, kteří mají tuto třídu na starosti. Terminologie je ve fylogenetice často matoucí a různí lidé někdy používají slova, která znamenají různé věci. Jedním z aspektů, který činí tyto termíny mimořádně matoucími, je to, že se vzájemně nevylučují a závisí na probíraných skupinách, takže například znak může být jak synapomorfie, tak autapomorfie (viz níže) v závislosti na zkoumaných skupinách. Ve snaze ujasnit si věci ve vlastní hlavě, a tak snad být schopen je efektivněji vyučovat, zde tedy uvádím některé běžně používané termíny v kladistice s doprovodnými definicemi a vysvětleními.
Apomprfie – Odvozený stav znaku. Je to cokoli, co je novinkou podél evoluční linie. Tedy cokoli, co se liší od ancestrálního stavu znaku. Například v rámci fyla Chordata by byla apomorfií evoluce páteře, což je něco, co linie, které se v evoluci Chordata rozvětvily dříve, nemají, a je to tedy novinka ve třídě Vertebrata.
Synapomorfie – Společný, odvozený stav znaku. Jedná se o apomorfii, kterou sdílejí dva taxony a o níž se předpokládá, že byla přítomna u společného předka těchto dvou taxonů. Příkladem může být peří u ptáků. Všichni ptáci mají peří a předpokládá se, že ho mají proto, že společný předek všech ptáků měl peří a předával tuto vlastnost z generace na generaci.
Plesiomorfie – ancestrální stav znaku. Jedná se o jakýkoli znak, který byl zděděn od předka skupiny. Například plazi jsou exotermní, neudržují stálou vnitřní tělesnou teplotu. Tuto vlastnost mají proto, že předek všech plazů byl exotermní. Tím se liší od synapomorfie, protože někteří potomci prvních plazů nejsou exotermní (ptáci jsou endotermní). Jinými slovy, tento znak je ancestrální, ale je sdílen některými, ale ne všemi předky; potomky.
Symplesiomorfie – sdílený, ancestrální stav znaku. Jedná se o jakýkoli znak, který byl zděděn od předka skupiny a byl předán do více než jedné linie potomků. Abychom pokračovali v příkladu pro pleziomorfii, skutečnost, že krokodýli i želvy jsou exotermní, ale
Autapomorfie – Odvozený znak, který je jedinečný pro určitý taxon. Nejsou užitečné při určování příbuznosti skupin, protože daný znak bude mít pouze jedna skupina. Jsou však velmi užitečné při určování taxonů. Například peří se vyskytuje pouze u ptáků. Proto je znak „peří“ a autapomorfie pro třídu Aves. Znak „peří“ je také synapomorfií pro taxony v rámci třídy Aves. Dravci i zpěvní ptáci mají peří a zdědili je po společném předkovi.
Otevřené kroužky = stav znaku po předkovi, vyplněné kroužky = stav znaku odvozeného.
Přečtěte si celý příspěvek „
.