Deportivo PesqueroRediger
Pizarro startede sin professionelle karriere som 17-årig med Deportivo Pesquero, et lille landshold i byen Chimbote i det nordlige Peru, hvor han spillede på et lille landshold. Hans første professionelle kamp var i 1996 mod Alianza Lima. Han scorede sine to første mål to uger senere mod Atletico Torino i Deportivo Pesqueros 2-1-sejr. Han sluttede sæsonen 1996 med tre mål i 16 kampe.
Alianza LimaRediger
Pizarro scorede 25 mål i løbet af to sæsoner med Alianza Lima og var en del af det Alianza-hold, der nåede andenpladsen i Torneo Apertura i Peru i 1999. Han spillede også syv gange i Copa Libertadores. Kort efter sin succes i Alianza blev Pizarro solgt til den tyske Bundesliga-klub Werder Bremen. Senere samme år fik han sin første landsholdskarakter for det peruanske fodboldlandshold.
Werder BremenRediger
Pizarro kom til Werder Bremen for første gang i sommeren 1999, da han kun var 20 år gammel. Hans første kamp i Bundesligaen blev spillet den 28. august i en 1-1 kamp mod Hertha BSC, hvor han kom ind som indskifter i anden halvleg. I sin anden optræden for klubben den 12. september scorede Pizarro sit første Bundesliga-mål i hjemmebanen mod 1. FC Kaiserslautern, som blev besejret med 5-0. En uge senere scorede Pizarro sit første hattrick i 7-2-målet mod VfL Wolfsburg og etablerede sig dermed som et af de mest lovende talenter på det tidspunkt. Han afsluttede sin første Bundesliga-sæson med at score 10 mål i 25 kampe. I den sæson fik Pizarro også sin debut i UEFA Cuppen, hvor han scorede tre gange i ni optrædener. I sin første kamp nogensinde den 15. september scorede han et dobbelt mål i en 5-0 hjemmesejr over norske FK Bodø/Glimt. Han var hovedperson i tredje runde mod det franske hold Olympique Lyonnais; efter at have tabt første kamp 3-0 på udebane hjalp Pizarro i returkampen Werder med at skabe et af de bedste comebacks i UEFA’s klubturneringshistorie, da han scorede sit holds fjerde mål i en 4-0-sejr på Weserstadion, et resultat, der gjorde det muligt for holdet at gå videre til næste runde med 4-3 efter samlet pointscore.
Pizarros 38 mål i løbet af to sæsoner for Werder Bremen gjorde den opstigende stjerne i peruviansk fodbold mere eftertragtet af managerne i de store europæiske klubber. Efter sæsonen 2000-01 meddelte Werder, at man ikke ville forhindre Pizarro i at skifte til en større klub, og konflikten om at sikre sig den peruvianske angribers tjenester blev intensiveret. Medierne oplyste, at Real Madrid og Barcelona i Spanien, Inter Milan i Italien og Werders Bundesliga-rivaler Borussia Dortmund var i spil til at skrive kontrakt med Pizarro. Den mest spekulerede transfer i peruviansk fodbold monopoliserede den nationale presses interesse. Efter at Pizarro tilsyneladende var udset til Spanien, afsluttede han ugers spekulationer ved at skrive under for Bayern München den 7. juni 2001.
Bayern MünchenRediger
Pizarro startede sin karriere i Bayern med et mål i det fjerde minut i kampen mod Schalke 04 på den anden spilledag i Bundesliga-sæsonen 2001-02. I sin første sæson scorede han 15 mål i 30 kampe i Bundesligaen, fire kampe i den tyske pokal, fire mål i 14 kampe i UEFA Champions League, en kamp i Intercontinental Cup og en kamp i UEFA Super Cup.
Pizarro var en vigtig spiller i Bayerns double i Bundesligaen og den tyske pokal i 2002-03-sæsonen. Den 30. november 2002 var Pizarro med i sin 100. Bundesliga-kamp i 2-0-hjemmesejren over Hertha BSC, takket være et dobbelt mål af Michael Ballack. I 2002-03-sæsonen scorede han 15 mål i 31 kampe i Bundesligaen, to mål i seks kampe i den tyske pokal, to mål i syv kampe i Champions League og to kampe i Liga Cuppen.
I 2003-04-sæsonen scorede han 11 mål i 31 kampe i Bundesligaen, et mål i fire kampe i den tyske pokal, syv kampe i Champions League og en kamp i Liga Cuppen.
I 2004-05-sæsonen scorede Pizarro 21 mål i 35 kampe.
I sæsonen 2005-06 scorede han 11 mål i 26 kampe i Bundesligaen, fem mål i fem kampe i den tyske pokal, et mål i seks kampe i Champions League og en optræden i Liga Cuppen.
Hans popularitet blandt Bayern-fans gav ham tilnavnet “Anden-Bomber” (“Andes Bomber”, en henvisning til hans sydamerikanske hjemland samt den legendariske Bayern-angriber Gerd Müller, der havde tilnavnet “Bomber”). Ved nogle lejligheder blev han også kaldt “Inka God” af medierne.
Pizarros kontrakt med de tyske mestre udløb ved udgangen af sæsonen 2006-07, og forhandlingerne om en forlængelse skred ikke frem, og Sevilla, Benfica og Rangers var klar til at træde til og gøre et kup. Pizarro afviste senere en kontraktforlængelse, som Bayerns formand Franz Beckenbauer tilbød ham, idet han krævede en lønforhøjelse, hvilket gjorde Karl-Heinz Rummenigge vred, som blev citeret for at sige, at “Enhver, der ønsker at tjene lige så meget som Shevchenko, må hellere begynde at spille som Shevchenko.”
Den 20. maj 2007 meddelte Bayern München, at Pizarro ville forlade klubben. Han sluttede sæsonen 2006-07 med 12 mål i 45 kampe.
ChelseaRediger
Den 1. juli 2007 skrev Chelsea officielt kontrakt med Pizarro og bekræftede, at han havde gennemført sit lægetjek og var blevet enig om personlige vilkår for at komme til klubben på en Bosman-transfer og underskrive en fireårig aftale. Han var den første peruvianske spiller, der skrev under for Chelsea. Pizarro afslørede også, at hans beslutning blev påvirket af råd fra hans landsholdskammerat Nolberto Solano, der spillede i England hos Newcastle, Aston Villa og West Ham United, samt Owen Hargreaves, der på det tidspunkt også spillede for Bayern München.
Pizarro fik tildelt nummer 14, det samme nummer, som han bærer for Peru, og hans tidligere trøjenummer i Bayern München. Han afløste Geremi som indehaver af trøjenummer 14 i Chelsea. Han fik sin debut mod Manchester United i FA Community Shield i 2007. Han kom ind som indskifter, men missede derefter et af straffesparkene i straffesparkskonkurrencen, da Chelsea tabte. Hans ligakarriere i Chelsea fik en god start, da han scorede et mål i sin debut i åbningsweekenden af Premier League-sæsonen 2007-08 mod Birmingham City. Men efter José Mourinhos afgang og underskrivelsen af den franske angriber Nicolas Anelka fandt Pizarro sig selv overflødig hos den daværende nye manager Avram Grant. Pizarro spillede dog en vigtig rolle i Chelseas videre avancement til fjerde runde af FA Cuppen i 2008 ved at bidrage til målet, der prellede af på QPR-keeper Lee Camp og ind i nettet. Derefter scorede han det eneste mål i en kamp mod Birmingham. Det betød, at hans eneste to Premier League-mål i en Chelsea-trøje begge kom i separate kampe mod Birmingham City.
Werder Bremen (lån)Edit
Den 15. august 2008 blev han udlejet indtil sæsonafslutningen til Werder Bremen. Kort efter annonceringen af, at Pizarro ville slutte sig til holdet, stod en stor gruppe Werder Bremen-fans i kø for at købe den nye Pizarro-trøje, hvilket viste, at Pizarro stadig er værdsat i Bremen, syv år efter han forlod klubben. Han fik tildelt trøje nummer 24 og scorede sit første mål under sin udlejningsperiode i sin anden optræden, idet han scorede Bremens første mål i et 3-2 nederlag til Borussia Mönchengladbach den 30. august. Pizarro scorede Bremens fjerde mål i klubbens imponerende 5-2-sejr over Bayern München den 20. september på Allianz Arena, hvor den tidligere Bremen-holdkammerat Tim Borowski scorede begge Bayerns mål.
Den 26. februar 2009 scorede Pizarro et dobbelt mål for Bremen i anden halvleg, da klubben kom tilbage fra et 2-0-underskud og sikrede sig uafgjort 2-2 og en samlet sejr på 3-3 (reglen om udebanemål) for at smide A.C. Milan ud af UEFA Cup’en i ottendedelsfinalerne. I returkampen i UEFA Cup-kvartfinalen mod italienske Udinese den 17. april scorede Pizarro én gang og holdkammerat Diego to gange, da holdene spillede en spændende 3-3-lige kamp, og Bremen gik videre til semifinalen med en samlet sejr på 6-4. Han scorede et hattrick den 4. maj, da Bremen slog Hannover med 4-1, hvilket holdt liv i kampen om en europæisk plads.
Pizarro spillede en afgørende rolle i Werders kvalifikation til UEFA Cup-finalen, da han scorede et mål i Bremens 3-2-nederlag på udebane til Hamburg den 7. maj, hvilket fuldendte en samlet sejr på 3-3 over de tyske rivaler i semifinalen. Da playmaker Diego var fraværende i finalen mod Shakhtar Donetsk, kunne Pizarro dog ikke redde holdet fra et 2-1-nederlag efter forlænget spilletid til de ukrainske mestre fra Shakhtar Donetsk den 20. maj 2009 på Şükrü Saracoğlu Stadion i Istanbul.
Pizarro var afgørende og vigtig for klubben i sin lånte tilbagevenden til Bundesligaen og scorede 17 mål i blot 26 Bundesligaoptrædener i 2008-09 for Bremen.
Tredje ophold i Werder BremenRediger
Den 18. august 2009 skrev Pizarro permanent under med Werder Bremen for et ikke oplyst beløb efter at have imponeret for Werder i den foregående sæson. I sin anden sæson hos Werder Bremen fortsatte han med at være topscorer i Bundesligaen med 16 mål. Den 23. oktober 2010 scorede Pizarro sit 134. mål i Bundesligaen, hvilket gjorde ham til den mest scorende udenlandskfødte spiller i ligaens historie efter at være på højde med Giovane Élber. Han sluttede sæsonen 2010-11 med 14 mål i 29 kampe. Den 15. maj 2012 meddelte Pizarro, at han ville forlade Werder Bremen til sommer. Han sluttede sin sidste sæson med 18 mål i 29 kampe.
Tilbage til Bayern MünchenRediger
Den 26. maj 2012 underskrev Pizarro en etårig aftale med sin tidligere tyske klub, Bayern München. Den 31. oktober 2012 scorede Pizarro to mål mod Kaiserslautern i DFB-Pokalen. I Champions League-kampen mod Lille den 7. november scorede Pizarro et hattrick inden for de første 33 minutter, da Bayern knuste deres franske modstandere med 6-1. Den 30. marts 2013 scorede Pizarro fire mål, hans første ligamål i Bundesligaen, og leverede to assists for Bayern i en 9-2-sejr mod Hamburg. Den 10. april 2013 kom Pizarro fra bænken og scorede et mål i det 90. minut mod Juventus i kvartfinalen i UEFA Champions League 2012-13, som endte med en 0-2-sejr til Bayern (0-4 samlet set). Pizarro scorede yderligere to gange og leverede yderligere to assists i Bayerns 6-1-hammerslag mod Hannover 96 den 20. april. Han sluttede sæsonen 2012-13 med 13 mål i 28 kampe.
Den 19. april 2014 scorede Pizarro i Bayerns 2-0-sejr over Eintracht Braunschweig, hvilket betød, at han havde scoret mod alle Bundesliga-klubber. I sæsonen 2013-14 scorede han 10 mål i 17 kampe i Bundesligaen, et mål i to kampe i den tyske pokal, seks kampe i Champions League, en kamp i den tyske Super Cup og en kamp i FIFA World Club Cup.
Hans kontrakt blev ikke forlænget efter sæsonen 2014-15, hvor det kun lykkedes ham at score ét mål i 17 kampe. Han scorede ikke i nogen af sine Bundesliga- eller Champions League-kampe i løbet af sæsonen.
Fjerde gang hos Werder BremenRediger
Den 7. september 2015 sluttede Pizarro sig til Werder Bremen for tredje gang i sin karriere og indgik en aftale om en etårig kontrakt. Han fik nummer 14. Den 2. marts 2016 nåede Pizarro op på 10 mål for sæsonen ved at score et hattrick i en 4-1-sejr ude over Bayer Leverkusen. Dermed slog den 37-årige spiller en rekord, der havde stået i 31 år, ved at blive den ældste spiller, der har scoret et hattrick i Bundesligaen. Han afsluttede sæsonen 2015-16. Den 2. juli 2017 meddelte Werder Bremen, at Pizarros kontrakt ikke ville blive forlænget, hvilket satte en stopper for hans fjerde ophold i klubben. Han sluttede 2016-17-sæsonen med et mål i 19 optrædener.
1. FC KölnRediger
Den 29. september 2017 underskrev Pizarro en etårig kontrakt med 1. FC Köln. De blev rykket ned fra Bundesligaen efter nederlag til SC Freiburg den 28. april 2018. Han sluttede sæsonen 2017-18 med et mål i 16 kampe.
Femte ophold i Werder BremenRediger
Den 29. juli 2018 underskrev Pizarro en etårig kontrakt med Werder Bremen, hvor han sluttede sig til dem for femte gang i sin karriere.
Den 16. februar 2019 blev Pizarro med sin udligning i stoptid i udekampen mod Hertha BSC den ældste målscorer i Bundesligaens historie i en alder af 40 år og 136 dage. Dermed blev den rekord, som Miroslav Votava (40 år og 121 dage) tidligere havde holdt siden august 1996, slået. Med sit mål blev han også den første og eneste spiller, der scorede i 21 på hinanden følgende kalenderår i Bundesligaen. Den 4. maj 2019 scorede han sit fjerde Bundesliga-mål i sæsonen, en 2-2-udligning mod Borussia Dortmund; hans femte mål blev afgørende i 2-1-kampen mod RB Leipzig, hvilket hævede aldersrekorden for en målscorer til 40 år og 227 dage.
Den 20. juli 2019 meddelte Pizarro, at 2019-20-sæsonen ville være hans sidste sæson, før han trak sig tilbage som fodboldspiller. I denne sæson spillede han 18 Bundesliga-kampe uden at score et mål. I alle disse kampe kom han fra udskiftningsbænken, herunder i sin sidste optræden mod Mainz 05 den 27. juni 2020. Han blev ikke længere brugt i de følgende to nedrykningskampe i nedrykningsspillet. I alt scorede han 197 mål i 490 Bundesliga-kampe.