La rivière Cooper est une rivière à marée principale dans l’État américain de Caroline du Sud. Les villes de Mt Pleasant, Charleston, North Charleston, Goose Creek, Moncks Corner et Hanahan sont situées le long de la rivière. Courte et large, la rivière est d’abord rejointe par la branche d’eau noire East Branch, puis plus en aval par la rivière marémotrice Wando. Presque immédiatement après, la rivière Cooper s’élargit dans son estuaire et s’unit à la rivière Ashley pour former le port de Charleston.
Longtemps utilisée comme une importante voie navigable commerciale, la branche ouest de la rivière Cooper était initialement reliée à la rivière Santee près de sa tête de navigation par le canal Santee, construit à la fin du 18e siècle. Bien que la branche Ouest s’élève toujours sous la forme d’un marécage d’eaux noires dans le centre du comté de Berkeley, son cours supérieur principal a été déplacé de manière transparente vers le lac Moultrie par le canal vintage Tail Race des années 1940. Le lac Moultrie est, à son tour, alimenté par le lac Marion grâce à un canal de dérivation construit à peu près à la même époque. Ce détournement artificiel du bassin de la rivière Cooper a essentiellement unifié les systèmes des rivières Santee et Cooper en une seule entité hydrologique de drainage.
La rivière a été nommée en l’honneur d’Anthony Ashley Cooper, 1er comte de Shaftesbury et principal Lord Propriétaire de la colonie de Caroline. Charleston a été fondée sur la rive ouest de la rivière Ashley en 1670 (à Charles Towne Landing), avant de traverser vers son emplacement péninsulaire actuel dix ans plus tard.
Le riz et l’indigo étaient les principales cultures de base cultivées dans les plantations entourant les marais saumâtres de la rivière Cooper du début de la période coloniale jusqu’à la fin de la guerre civile. Les anciennes plantations le long de la rivière comprennent Lewisfield, Mulberry, Middleburg, Quinby et Mepkin, qui est maintenant exploitée comme l’abbaye de Mepkin, un monastère trappiste. Nombre de ces structures et d’autres contribuent au Cooper River Historic District, un district historique national qui englobe les zones situées le long des deux bras de la rivière. Outre le jardin botanique de l’abbaye de Mepkin, les attractions voisines comprennent les jardins de cyprès et le parc du canal Old Santee.
L’île Daniel et l’île Drum (inhabitée) sont adjacentes à la rivière. Des terminaux de fret, une usine de papier et l’ancienne base navale de Charleston bordent ses rives. Le musée naval et maritime de Patriot’s Point est situé à l’embouchure du fleuve. Quatre navires-musées sont amarrés à Patriot’s Point, notamment l’USS Yorktown, un porte-avions de la Seconde Guerre mondiale.
Goose Creek, un affluent de la rivière Cooper, était le site d’une base de sous-marins de la marine américaine jusqu’à la fin des années 1990. Elle a fonctionné comme une installation de manutention d’armes nucléaires desservant les sous-marins balistiques de la flotte jusqu’à l’avènement du plus grand missile balistique lancé par sous-marin Trident. Comme les sous-marins de classe Ohio nécessitaient un tirant d’eau plus important, la manutention des armes nucléaires a dû être déplacée vers une autre installation.