The Cooper River jest głównie pływową rzeką w amerykańskim stanie Karolina Południowa. Wzdłuż rzeki położone są miasta Mt. Pleasant, Charleston, North Charleston, Goose Creek, Moncks Corner i Hanahan. Krótka i szeroka, rzeka łączy się najpierw z czarną, wodną East Branch, a następnie dalej w dół rzeki z pływową Wando River. Prawie natychmiast po tym, rzeka Cooper rozszerza się do swojego ujścia i łączy się z rzeką Ashley, tworząc port Charleston.
Długo używana jako ważna handlowa droga wodna, zachodnia odnoga rzeki Cooper była początkowo połączona z rzeką Santee w pobliżu jej głowicy nawigacyjnej przez kanał Santee, zbudowany pod koniec XVIII wieku. Choć West Branch nadal wznosi się jako czarno-wodne bagno w centralnej części hrabstwa Berkeley, jej główne źródła zostały płynnie przeniesione do jeziora Moultrie przez zabytkowy kanał Tail Race z lat 40-tych XX wieku. Jezioro Moultrie jest z kolei zasilane z jeziora Marion przez kanał objazdowy zbudowany w tym samym okresie. To sztuczne przekierowanie Cooper River basin zasadniczo zjednoczył Santee i Cooper systemów rzecznych w jeden podmiot hydrologicznych drainage.
Rzeka została nazwana dla Anthony Ashley Cooper, 1st Earl of Shaftesbury i głównego Lord Proprietor Kolonii Carolina. Charleston został założony na zachodnim brzegu rzeki Ashley w 1670 r. (w Charles Towne Landing), a dziesięć lat później przeniósł się na obecny półwysep.
Ryż i indygo były podstawowymi roślinami uprawianymi na plantacjach otaczających słonawe bagna rzeki Cooper od wczesnego okresu kolonialnego do końca wojny secesyjnej. Dawne plantacje wzdłuż rzeki to Lewisfield, Mulberry, Middleburg, Quinby i Mepkin, które obecnie funkcjonuje jako Mepkin Abbey, klasztor Trapistów. Wiele z tych i innych budowli składa się na Cooper River Historic District, narodowy okręg historyczny, który obejmuje obszary wzdłuż obu odnóg rzeki. Oprócz Ogrodu Botanicznego Opactwa Mepkin, pobliskie atrakcje obejmują Cypress Gardens i Old Santee Canal Park.
Daniel Island i Drum Island (niezamieszkane) przylegają do rzeki. Terminale towarowe, papiernia i dawna baza marynarki wojennej w Charleston znajdują się na jej brzegu. Przy ujściu rzeki znajduje się muzeum morskie Patriot’s Point. W Patriot’s Point spoczywają cztery statki muzealne, przede wszystkim USS Yorktown, lotniskowiec z okresu II wojny światowej.
Goose Creek, dopływ rzeki Cooper, był miejscem bazy okrętów podwodnych Marynarki Wojennej Stanów Zjednoczonych do późnych lat dziewięćdziesiątych. Działała jako zakład obsługi broni jądrowej obsługujący balistyczne okręty podwodne floty do czasu pojawienia się większego pocisku balistycznego Trident wystrzeliwanego z okrętów podwodnych. Ponieważ okręty podwodne klasy Ohio wymagały głębszego zanurzenia, obsługa broni jądrowej musiała zostać przeniesiona do innego obiektu.