Cyanate は両座配位子で、窒素原子または酸素原子、あるいはその両方に一対の電子を供与することができます。 構造的には、異性体は錯体の形状によって区別される。 N-結合型シアネート錯体では、M-NCOユニットは直線的な構造をとることがあるが、O-結合型シアネートでは、M-O-Cユニットは曲がっている。 したがって、銀シアナート錯体である-は、X線結晶構造解析で示されるように直線的な構造を持っている。 しかし、シアネート銀の結晶構造は、窒素原子と銀原子がジグザグに連なった構造を示している。 また、Ni-N-C基が曲がっている構造
NCO / \Ni Ni \ / OCN
も存在する
異性体の区別には赤外分光法が多用されている。 2価の金属の錯体の多くはN-結合を持つ。 O結合はn-, M=Mo(III), Re(IV), Re(V)型の錯体で示唆されている。 黄色のRh(PPh3)3(NCO)とオレンジ色のRh(PPh3)3(OCN)は連結異性体で、赤外線スペクトルに違いを示し、診断に利用できる（PPh3はトリフェニルフォフィンの略）
シアナートイオンはそのドナー原子の両方を用いて、二つの金属原子の間に橋渡しすることができます。 例えば、この構造は化合物2に見られる。 この化合物ではNi-N-CユニットとNi-O-Cユニットの両方が曲がっているが、最初のケースでは窒素原子を介しての供与である
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