コスミドは主に細菌のオリV、抗生物質選択マーカー、クローニングサイトを持つプラスミドだが、バクテリオファージラムダから得たコスサイトを一つ、あるいは最近では二つ搭載している。 実験の目的に応じて、広宿主域コスミド、シャトルコスミド、哺乳類コスミド（SV40オリVと哺乳類選択マーカーを連結したもの）などが利用できる。 コスミッドの容量はベクターの大きさによって異なりますが、通常40-45kb程度です。 クローニングの手順は、2つのベクターアームが生成され、それが外来DNAと結合される。 野生型コスミドDNAに対する選択は、サイズ排除によって簡単に行われる。 したがって、コスミドは常にコロニーを形成し、プラークを形成することはない。
組換えラムダまたはコスミドライブラリーを構築した後、全DNAはin vitroパッケージングと呼ばれる技術により、適切な大腸菌宿主に移植される。 必要なパッケージング抽出物は、大腸菌cI857リソゲン（それぞれred- gam- SamおよびDam（頭部集合）およびEam（尾部集合））由来である。 これらの抽出物は、in vitroで組換え分子を認識してパッケージングし、成熟ファージ粒子（ラムダベースベクター）またはファージ殻に含まれる組換えプラスミド（コスミド）のいずれかを生成することになる。 これらの違いは、ラムダ置換型ベクターに見られる感染頻度の違いに反映されています。 これは、わずかに低いローディング容量を補うものである。
ターゲットDNA：クローン化されるゲノムDNAは、適切なサイズの制限断片に切断される必要がある。 これは通常、染色体スクランブル、すなわち物理的にリンクしていない断片のライゲーションを避けるために、部分的制限とそれに続くサイズ分画または脱リン酸化（calf-intestine phosphataseを使用）のいずれかによって行われる
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