Forum:Chickenosaurus

Aici vom discuta despre proiectul Chickenosaurus al lui Jack Horner. Trebuie să știm ce modificări vor fi necesare pentru a reda unui pui dinții, coada etc. De asemenea, discutăm despre criticile la adresa proiectului.

Vă rugăm să dați surse pentru fiecare afirmație și citat.

Progresele pe care le facem pe acest forum ar trebui să fie încorporate în articolul despre Chickenosaur.

Coada

Păsările antice, precum Archaeopteryx, aveau o coadă lungă de reptilă. Păsările moderne au încă o coadă vestigială. Obiectivul principal al proiectului lui Horner este de a identifica gena (genele) care determină inhibarea dezvoltării cozii în stadiul embrionar. Prin modificarea tiparelor de expresie ale acestor gene, ar putea fi crescuți pui cu cozi lungi de dinozaur.

Ideea a atras critici din partea multor oameni de știință. Sean Carroll, un biolog specializat în biologia dezvoltării, a experimentat cu dezvoltarea insectelor, iar aceste experimente le-au ucis de obicei.

Mâini și gheare

Cred că crearea unui animal foarte asemănător cu Dryosaurus sau Hypsilophodon va fi destul de ușoară folosind această metodă, deoarece puiul are deja o structură a șoldului de tip orithischian. Jurassic Park Treasury (discuție) 04:56, 10 martie 2014 (UTC)

Snout

În 2011, un om de știință a reușit să creeze un pui cu bot. Articolul se află pe New Scientist, deci trebuie să vă înregistrați pentru a citi, dar articolul poate fi citit și aici. Trebuie precizat că, totuși, ei doar au oprit fuziunea premaxilei. Jurassic Park Treasury (discuție) 22:24, 4 decembrie 2013 (UTC)

Dinți

Am auzit că gena dinților la pui îi omoară înainte de eclozare. Se poate face ca gena să nu fie letală, sau va trebui să renunțăm de tot la dinți? Și sunt curios să văd proteinele și secvențele reglatoare. Sunt în NCBI? Jurassic Park Treasury (discuție) 06:15, April 10, 2013 (UTC)

Se pare că păsările nu pot dezvolta dinți funcționali cu smalț. Dinții dezvoltați în embrioni erau doar niște muguri de dinți inutili. Dar chiar dacă genele smalțului dentar la pui au dispărut sau au devenit pseudogene, ar fi posibil să se facă din nou funcționale pseudogenele? Trezoreria Jurassic Park (discuție) 01:56, April 15, 2013 (UTC)

Iată o secvență de ADN la pui care obișnuia să fie o smalțină funcțională. De-a lungul timpului, a devenit o pseudogena. Dar dacă putem afla ce a făcut-o nefuncțională, am putea eventual să anulăm mutațiile punctuale și să o transformăm din nou într-o genă funcțională? Jurassic Park Treasury (discuție) 06:02, April 16, 2013 (UTC)

Tocmai am comparat enamelina de pui cu enamelina de crocodil pe Clustal Omega. Se pare că enamelina de pui are MULTE goluri în ea. De asemenea, are destul de multe diferențe, deci cred că vor fi și o mulțime de mutații punctuale de detectat. Jurassic Park Treasury (discuție) 06:15, April 16, 2013 (UTC)

Dacă pseudogena de enamelină de la pui ar fi comparată cu genele funcționale ale crocodililor sau aligatorilor, ar fi posibil să se detecteze mutațiile care au făcut gena nefuncțională și să se facă inginerie inversă pentru a o aduce la o stare ancestrală funcțională? Și dacă da, s-ar putea face acest lucru și cu gena AMEL? Pentru ca dinozaurul găină să fie un dinozaur non-avian, pentru mine trebuie să aibă brațe cu gheare, o coadă lungă ȘI dinți funcționali. Ornithomimidele sunt singura excepție. Jurassic Park Treasury (discuție) 06:41, May 20, 2013 (UTC)

Am făcut câteva cercetări. Chiar dacă ați obține niște gene funcționale ale smalțului, ar trebui să găsiți o modalitate prin care genele să fie exprimate. Singurul lucru cunoscut care permite dezvoltarea mugurilor de dinți de pui este talpid2, care este letal pentru că nu numai că permite formarea dinților, dar și pentru că dă peste cap sistemele de organe.

Va trebui să găsim o modalitate prin care talpid2 să fie exprimat în maxilare fără ca acesta să afecteze alte părți ale corpului. Jurassic Park Treasury (discuție) 03:06, March 25, 2014 (UTC)

Ce ziceți de injectarea smalțului sau a talpid2 la momentul potrivit în mugurii dentare? Știți dacă a încercat cineva așa ceva? BastionMonk (talk) 13:17, June 3, 2014 (UTC)

Bine, am aflat acum că multe specii fără smalț au gene de smalț nefuncționale, parțial din cauza prezenței codonilor de oprire în pseudogenele de smalț rămase. Codonii de oprire pot fi TGA, TAA sau TAG. Secvența pseudogenei de enamelină a puiului se află în GenBank, așa că acum încerc să găsesc toți codonii de oprire din ea. Apoi am putea să le eliminăm.

Cu toate acestea, pentru a nu confunda părțile normale ale secvenței cu codonii de oprire, nu voi număra secvențele TGA, TAA sau TAG de la sfârșitul secțiunilor de zece nucleotide în care sunt prezentate secvențele din GenBank ca format.

De exemplu, acesta ar conta ca un codon de oprire în căutarea mea: TAGgtcagg

Cu toate acestea, acest lucru nu ar fi: gtacaggTAG

Ar fi aceasta o metodă bună pentru a evita confundarea codonilor normali cu codonii de oprire? Dacă acest lucru are succes, cred că am putea crea o genă funcțională a smalțului pentru chickenosaurus. Jurassic Park Treasury (discuție) 08:26, June 3, 2014 (UTC)

Nu se presupune că codonul de oprire ar trebui să fie în partea dreaptă? BastionMonk (discuție) 13:17, June 3, 2014 (UTC) Am comparat gena smalțului cu cea a crocodililor. Similitudinile au fost FOARTE slabe. M-am uitat în articolul lui Sire et al. Nici ei nu au găsit rezultate bune când au comparat exone foarte conservate ale genei ENAM a crocodililor cu întregul cromozom 4 al găinilor. Au găsit unele similitudini cu acea regiune „speudogene”, dar nu sunt mulțumiți de ea. Ei cred că genele pentru ENAM și AMBN sunt cel mai probabil pierdute din genomul păsărilor. Cromozomul 4 a fost rearanjat chiar înainte de ultimul strămoș comun al păsărilor. În timpul acestei rearanjări, regiunea ENAM a fost înlocuită până la marginea cromozomului. Poate că acea regiune „speudogenă” conține unele fracțiuni ale genei, sau poate că nu. Cu toate acestea, ei nu s-au uitat la niciun genom de ratite. Așa că, poate… M-am uitat rapid din nou în articolul lui Griffin et al. „The evolution of the avian genome as revealed by comparative molecular cytogenetics”. Ei compară cromozomii diferitelor păsări și broaște țestoase pe baza cromozomului-„vopsea”. Ei observă într-adevăr că la puiul de găină cromozomul 4 au avut loc rearanjări și fuziuni cu alți cromozomi. Cu toate acestea, cromozomul 4 este încă nealterat la Rhea, Emu, Mallard, Muscovy, prepeliță californiană, curcan, fazan etc. Dacă acest lucru este adevărat, trebuie doar să așteptăm până când una dintre aceste păsări va fi complet secvențiată și să ne uităm cum arată genele dinților lor. BastionMonk (discuție) 13:59, 3 iunie 2014 (UTC) Dintre acestea, cred că genomul rață sălbatică și al curcanului au fost secvențiate. Cu toate acestea, nu găsesc gena ENAM în nicio bază de date. Totuși, emușii și struții sună ca niște candidați buni. Se întâmplă să locuiesc într-un oraș cu o universitate bună, așa că poate aș putea întreba un genetician sau un biolog evoluționist dacă este interesat să afle dacă ratitele își mai păstrează genele dinților. Jurassic Park Treasury (discuție) 21:13, June 3, 2014 (UTC) Acesta este un subiect foarte specific. Nu cred că un genetician oarecare știe asta. Mă întreb cum vrea Jack Horner să abordeze această problemă. Am comparat prin BLAST gena ENAM a crocodilului cu întreaga bază de date aviară. Nu am obținut niciun rezultat bun. Așadar, cred că regiunea cromozomului 4 nu este secvențiată la suficienți arcaozauri. BastionMonk (discuție) 07:04, June 4, 2014 (UTC)

Probleme

Un critic a spus următoarele: „Am mai văzut discursul TED al Dr. Horner pe această temă – nu-mi place din mai multe motive. Cel mai important dintre aceste motive este faptul că ideea de a face inginerie inversă a unui dinozaur dintr-o găină este o interpretare greșită grosolană a științei reale. Evo-devo studiază relațiile evolutive dintre organisme. Prin experimente complexe și cu adevărat strălucite, cercetătorii încep să deslușească direcțiile de „construire” a unui organism și modul în care aceste direcții au evoluat pentru a crea viața pe care o vedem în jurul nostru. Aceștia sunt adesea interesați de genele și combinațiile de gene care codifică trăsăturile ancestrale, însă aceasta nu este o căutare a unei modalități de a reconstrui dinozaurii. În schimb, evo-devo este mai degrabă o căutare pentru a înțelege cum/din ce cauză linajele complexe evoluează de la o stare la alta.”

Dacă acest lucru este corect, atunci bănuiesc că Horner nu prea înțelege toată chestiunea evo-devo. Un alt critic a subliniat, de asemenea, că Horner pare să urmeze noțiunea discreditată conform căreia „ontogeneza urmează filogenia”. Jurassic Park Treasury (discuție) 06:03, 4 decembrie 2013 (UTC)

Este ca și cum ai spune că microbiologia este studiul modului în care funcționează mecanismele celulare, nu căutarea de noi medicamente. Și, prin urmare, încercarea de a crea un nou medicament folosind microbiologia este o „interpretare greșită gravă a științei reale”. Dacă Horner s-ar fi înșelat atât de mult, nu ar fi putut să își publice planul în NewScientist. „ontogeneza urmează filogenia”. Este adevărat că dezvoltarea NU este o repetare 100% a evoluției. Cu toate acestea, nu este în niciun caz discreditată. Dezvoltarea embrionară este încă folosită de filogeniști și de biologii evoluționiști. Ea se regăsește în toate manualele despre evoluție. De exemplu: Freeman S.,Herron J.C. (2004) Evolutionary Analysis (3th Ed.). Pagina 51, 52.

BastionMonk (discuție) 11:43, December 4, 2013 (UTC)

Dinozaur, sau pui ciudat?

Mulți critici ai proiectului susțin că puiul de dinozaur nu ar fi un adevărat dinozaur non-avian, ci doar o pasăre cu coadă și brațe. Atavismele nu schimbă specia unui organism. Dacă vedeți un cal în miniatură născut cu degete în plus, îl numiți Eohippus? Jurassic Park Treasury (discuție) 00:32, 22 octombrie 2013 (UTC)

În prezent, nu există reguli cu privire la locul animalelor artificiale în arborele taxonomic. Craig Venter a dat bacteriei sale modificate de Mycoplasma „Mycoplasma laboratorium”. Așadar, modificarea i-a schimbat specia. Un cal modern cu degete nu este Eohippus, deoarece atunci ar avea nevoie de aproape TOATE caracteristicile pe care le are Eohippus. Cu toate acestea, dacă aveți un singur cal cu degete de la picioare, majoritatea taxonomiștilor îl vor numi doar un cal cu o aberație. Cu toate acestea, dacă aveți o întreagă turmă de astfel de creaturi, probabil că îi vor da un nume nou, deoarece toți Equus nu au degete. Denumirile taxonomice sunt mai degrabă ceva inventat de om decât descoperit. Așadar, ce ar fi un chickenosaur? Ei bine, dacă este vorba de un singur animal, majoritatea oamenilor îl vor numi pur și simplu o găină cu câteva abrevieri. Cu toate acestea, dacă aveți o turmă de aceste creaturi care se reproduc, probabil că îi vor da un nume nou. Puii nu au dinți, nu au coadă și nu au gheare. Mai mult, nici măcar o singură cladă de păsări existente nu are aceste caracteristici. Așadar, taxonomia va trebui fie să inventeze o nouă cladă, fie să le plaseze într-o cladă deja existentă (care ar putea face parte din grupul dinozaurilor non-aviari). BastionMonk (discuție) 20:27, Octombrie 22, 2013 (UTC)

Reproducere

Horner a spus că dacă un chickenosaurus s-ar împerechea cu un alt chickenosaurus, ar produce un pui, deoarece genele în sine nu au fost modificate. Este adevărat acest lucru? Jurassic Park Treasury (discuție) 02:15, 6 martie 2014 (UTC)

În carte a spus că nu va schimba ADN-ul găinilor. Horner vrea să bage o mulțime de tuburi într-un embrion de pui în dezvoltare. În stadiile potrivite de dezvoltare vor fi introduși în embrion hormoni și factori de transcripție. Dacă acest lucru este făcut în mod corect, embrionul de pui se va dezvolta într-un puiosaur. Horner și echipa sa vor trebui să descopere metoda corectă prin presupuneri educate și încercări și erori. Acest lucru este mai ușor de realizat prin manipularea manuală a nivelurilor de hormoni decât prin modificarea secvențelor de reglementare a hormonilor. De asemenea, este salvator, deoarece chickenosaurul nu se poate reproduce dacă ar scăpa în sălbăticie. Dar nu vă faceți griji. Odată ce chickenosaurul este creat cu succes, este posibil să i se modifice ADN-ul astfel încât fenotipul chickenosaurului să fie codificat și în genomul său. Dar acesta ar fi un proiect și mai mult. BastionMonk (discuție) 09:58, 6 martie 2014 (UTC)